Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cul3Q9JLV5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cul3Q9JLV5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cul3Q9JLV5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cul3Q9JLV5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cul3Q9JLV5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cul3Q9JLV5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cul3Q9JLV5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cul3Q9JLV5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cul3Q9JLV5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cul3Q9JLV5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cul3Q9JLV5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cul3Q9JLV5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cul3Q9JLV5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cul3Q9JLV5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cul3Q9JLV5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cul3Q9JLV5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cul3Q9JLV5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cul3Q9JLV5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cul3Q9JLV5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cul3Q9JLV5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cul3Q9JLV5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cul3Q9JLV5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cul3Q9JLV5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cul3Q9JLV5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cul3Q9JLV5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cul3Q9JLV5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cul3Q9JLV5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cul3Q9JLV5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cul3Q9JLV5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cul3Q9JLV5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cul3Q9JLV5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cul3Q9JLV5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cul3Q9JLV5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cul3Q9JLV5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cul3Q9JLV5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cul3Q9JLV5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cul3Q9JLV5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cul3Q9JLV5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cul3Q9JLV5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cul3Q9JLV5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cul3Q9JLV5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cul3Q9JLV5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cul3Q9JLV5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cul3Q9JLV5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cul3Q9JLV5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cul3Q9JLV5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cul3Q9JLV5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cul3Q9JLV5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cul3Q9JLV5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cul3Q9JLV5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cul3Q9JLV5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cul3Q9JLV5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cul3Q9JLV5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cul3Q9JLV5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cul3Q9JLV5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cul3Q9JLV5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cul3Q9JLV5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cul3Q9JLV5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cul3Q9JLV5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cul3Q9JLV5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cul3Q9JLV5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cul3Q9JLV5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cul3Q9JLV5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cul3Q9JLV5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cul3Q9JLV5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cul3Q9JLV5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cul3Q9JLV5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cul3Q9JLV5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cul3Q9JLV5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cul3Q9JLV5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cul3Q9JLV5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cul3Q9JLV5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cul3Q9JLV5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cul3Q9JLV5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cul3Q9JLV5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cul3Q9JLV5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cul3Q9JLV5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cul3Q9JLV5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cul3Q9JLV5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cul3Q9JLV5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cul3Q9JLV5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cul3Q9JLV5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cul3Q9JLV5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul3Q9JLV5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul3Q9JLV5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul3Q9JLV5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul3Q9JLV5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul3Q9JLV5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul3Q9JLV5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul3Q9JLV5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul3Q9JLV5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul3Q9JLV5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul3Q9JLV5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul3Q9JLV5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul3Q9JLV5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul3Q9JLV5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul3Q9JLV5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul3Q9JLV5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul3Q9JLV5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms