Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Pkd2l2Q9JLG4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pkd2l2Q9JLG4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pkd2l2Q9JLG4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pkd2l2Q9JLG4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pkd2l2Q9JLG4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pkd2l2Q9JLG4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pkd2l2Q9JLG4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pkd2l2Q9JLG4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pkd2l2Q9JLG4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pkd2l2Q9JLG4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pkd2l2Q9JLG4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pkd2l2Q9JLG4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pkd2l2Q9JLG4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pkd2l2Q9JLG4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pkd2l2Q9JLG4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pkd2l2Q9JLG4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pkd2l2Q9JLG4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pkd2l2Q9JLG4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pkd2l2Q9JLG4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pkd2l2Q9JLG4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pkd2l2Q9JLG4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pkd2l2Q9JLG4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pkd2l2Q9JLG4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pkd2l2Q9JLG4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pkd2l2Q9JLG4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pkd2l2Q9JLG4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pkd2l2Q9JLG4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pkd2l2Q9JLG4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pkd2l2Q9JLG4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pkd2l2Q9JLG4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pkd2l2Q9JLG4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pkd2l2Q9JLG4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Pkd2l2Q9JLG4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pkd2l2Q9JLG4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pkd2l2Q9JLG4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkd2l2Q9JLG4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkd2l2Q9JLG4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkd2l2Q9JLG4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkd2l2Q9JLG4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkd2l2Q9JLG4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkd2l2Q9JLG4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkd2l2Q9JLG4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkd2l2Q9JLG4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkd2l2Q9JLG4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkd2l2Q9JLG4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkd2l2Q9JLG4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkd2l2Q9JLG4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkd2l2Q9JLG4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkd2l2Q9JLG4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pkd2l2Q9JLG4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pkd2l2Q9JLG4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pkd2l2Q9JLG4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkd2l2Q9JLG4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkd2l2Q9JLG4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pkd2l2Q9JLG4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pkd2l2Q9JLG4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pkd2l2Q9JLG4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkd2l2Q9JLG4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkd2l2Q9JLG4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkd2l2Q9JLG4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkd2l2Q9JLG4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkd2l2Q9JLG4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkd2l2Q9JLG4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkd2l2Q9JLG4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkd2l2Q9JLG4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pkd2l2Q9JLG4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pkd2l2Q9JLG4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pkd2l2Q9JLG4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pkd2l2Q9JLG4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pkd2l2Q9JLG4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pkd2l2Q9JLG4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Pkd2l2Q9JLG4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pkd2l2Q9JLG4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkd2l2Q9JLG4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkd2l2Q9JLG4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkd2l2Q9JLG4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkd2l2Q9JLG4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pkd2l2Q9JLG4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pkd2l2Q9JLG4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pkd2l2Q9JLG4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pkd2l2Q9JLG4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pkd2l2Q9JLG4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pkd2l2Q9JLG4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pkd2l2Q9JLG4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkd2l2Q9JLG4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms