Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irx5Q9JKQ4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irx5Q9JKQ4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irx5Q9JKQ4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irx5Q9JKQ4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irx5Q9JKQ4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irx5Q9JKQ4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irx5Q9JKQ4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irx5Q9JKQ4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irx5Q9JKQ4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irx5Q9JKQ4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irx5Q9JKQ4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Irx5Q9JKQ4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irx5Q9JKQ4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irx5Q9JKQ4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irx5Q9JKQ4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irx5Q9JKQ4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irx5Q9JKQ4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irx5Q9JKQ4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irx5Q9JKQ4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irx5Q9JKQ4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irx5Q9JKQ4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irx5Q9JKQ4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irx5Q9JKQ4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irx5Q9JKQ4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irx5Q9JKQ4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irx5Q9JKQ4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irx5Q9JKQ4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irx5Q9JKQ4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irx5Q9JKQ4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irx5Q9JKQ4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irx5Q9JKQ4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irx5Q9JKQ4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irx5Q9JKQ4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irx5Q9JKQ4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irx5Q9JKQ4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irx5Q9JKQ4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irx5Q9JKQ4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irx5Q9JKQ4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irx5Q9JKQ4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irx5Q9JKQ4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irx5Q9JKQ4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irx5Q9JKQ4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irx5Q9JKQ4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irx5Q9JKQ4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irx5Q9JKQ4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irx5Q9JKQ4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irx5Q9JKQ4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irx5Q9JKQ4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irx5Q9JKQ4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irx5Q9JKQ4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irx5Q9JKQ4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irx5Q9JKQ4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irx5Q9JKQ4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irx5Q9JKQ4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Irx5Q9JKQ4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irx5Q9JKQ4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irx5Q9JKQ4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irx5Q9JKQ4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irx5Q9JKQ4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irx5Q9JKQ4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irx5Q9JKQ4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irx5Q9JKQ4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irx5Q9JKQ4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irx5Q9JKQ4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irx5Q9JKQ4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irx5Q9JKQ4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irx5Q9JKQ4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irx5Q9JKQ4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Irx5Q9JKQ4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irx5Q9JKQ4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irx5Q9JKQ4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irx5Q9JKQ4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irx5Q9JKQ4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irx5Q9JKQ4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irx5Q9JKQ4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irx5Q9JKQ4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irx5Q9JKQ4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irx5Q9JKQ4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irx5Q9JKQ4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irx5Q9JKQ4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irx5Q9JKQ4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irx5Q9JKQ4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irx5Q9JKQ4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irx5Q9JKQ4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irx5Q9JKQ4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irx5Q9JKQ4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irx5Q9JKQ4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irx5Q9JKQ4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irx5Q9JKQ4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irx5Q9JKQ4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irx5Q9JKQ4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Irx5Q9JKQ4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Irx5Q9JKQ4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Irx5Q9JKQ4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Irx5Q9JKQ4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Irx5Q9JKQ4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Irx5Q9JKQ4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irx5Q9JKQ4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irx5Q9JKQ4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms