Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trem1Q9JKE2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trem1Q9JKE2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trem1Q9JKE2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trem1Q9JKE2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trem1Q9JKE2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trem1Q9JKE2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trem1Q9JKE2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trem1Q9JKE2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trem1Q9JKE2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trem1Q9JKE2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trem1Q9JKE2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trem1Q9JKE2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trem1Q9JKE2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trem1Q9JKE2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Trem1Q9JKE2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Trem1Q9JKE2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trem1Q9JKE2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trem1Q9JKE2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Trem1Q9JKE2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trem1Q9JKE2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trem1Q9JKE2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trem1Q9JKE2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Trem1Q9JKE2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trem1Q9JKE2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trem1Q9JKE2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trem1Q9JKE2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trem1Q9JKE2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trem1Q9JKE2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trem1Q9JKE2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Trem1Q9JKE2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trem1Q9JKE2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Trem1Q9JKE2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trem1Q9JKE2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trem1Q9JKE2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trem1Q9JKE2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trem1Q9JKE2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trem1Q9JKE2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trem1Q9JKE2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trem1Q9JKE2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trem1Q9JKE2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trem1Q9JKE2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trem1Q9JKE2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trem1Q9JKE2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trem1Q9JKE2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trem1Q9JKE2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trem1Q9JKE2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trem1Q9JKE2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trem1Q9JKE2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trem1Q9JKE2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trem1Q9JKE2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trem1Q9JKE2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trem1Q9JKE2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trem1Q9JKE2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms