Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK97

Kcnq4, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnq4Q9JK97 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcnq4Q9JK97 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcnq4Q9JK97 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Kcnq4Q9JK97 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kcnq4Q9JK97 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kcnq4Q9JK97 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kcnq4Q9JK97 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kcnq4Q9JK97 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kcnq4Q9JK97 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcnq4Q9JK97 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcnq4Q9JK97 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcnq4Q9JK97 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcnq4Q9JK97 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcnq4Q9JK97 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kcnq4Q9JK97 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kcnq4Q9JK97 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kcnq4Q9JK97 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kcnq4Q9JK97 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcnq4Q9JK97 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcnq4Q9JK97 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcnq4Q9JK97 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcnq4Q9JK97 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcnq4Q9JK97 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcnq4Q9JK97 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcnq4Q9JK97 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcnq4Q9JK97 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcnq4Q9JK97 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcnq4Q9JK97 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcnq4Q9JK97 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcnq4Q9JK97 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcnq4Q9JK97 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcnq4Q9JK97 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcnq4Q9JK97 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcnq4Q9JK97 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcnq4Q9JK97 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcnq4Q9JK97 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcnq4Q9JK97 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcnq4Q9JK97 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcnq4Q9JK97 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcnq4Q9JK97 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcnq4Q9JK97 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcnq4Q9JK97 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcnq4Q9JK97 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcnq4Q9JK97 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcnq4Q9JK97 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kcnq4Q9JK97 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kcnq4Q9JK97 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kcnq4Q9JK97 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kcnq4Q9JK97 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kcnq4Q9JK97 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kcnq4Q9JK97 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcnq4Q9JK97 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcnq4Q9JK97 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcnq4Q9JK97 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcnq4Q9JK97 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcnq4Q9JK97 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcnq4Q9JK97 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcnq4Q9JK97 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcnq4Q9JK97 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kcnq4Q9JK97 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kcnq4Q9JK97 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kcnq4Q9JK97 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kcnq4Q9JK97 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kcnq4Q9JK97 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kcnq4Q9JK97 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kcnq4Q9JK97 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kcnq4Q9JK97 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kcnq4Q9JK97 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcnq4Q9JK97 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcnq4Q9JK97 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcnq4Q9JK97 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcnq4Q9JK97 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcnq4Q9JK97 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcnq4Q9JK97 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcnq4Q9JK97 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnq4Q9JK97 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnq4Q9JK97 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnq4Q9JK97 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnq4Q9JK97 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnq4Q9JK97 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnq4Q9JK97 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kcnq4Q9JK97 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kcnq4Q9JK97 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kcnq4Q9JK97 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Kcnq4Q9JK97 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kcnq4Q9JK97 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kcnq4Q9JK97 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kcnq4Q9JK97 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kcnq4Q9JK97 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Kcnq4Q9JK97 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kcnq4Q9JK97 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kcnq4Q9JK97 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kcnq4Q9JK97 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kcnq4Q9JK97 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnq4Q9JK97 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnq4Q9JK97 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnq4Q9JK97 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnq4Q9JK97 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnq4Q9JK97 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnq4Q9JK97 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms