Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJG6

Tmem47, Transmembrane protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem47Q9JJG6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmem47Q9JJG6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmem47Q9JJG6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmem47Q9JJG6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmem47Q9JJG6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmem47Q9JJG6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmem47Q9JJG6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmem47Q9JJG6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmem47Q9JJG6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmem47Q9JJG6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmem47Q9JJG6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmem47Q9JJG6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmem47Q9JJG6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmem47Q9JJG6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmem47Q9JJG6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmem47Q9JJG6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmem47Q9JJG6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmem47Q9JJG6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmem47Q9JJG6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmem47Q9JJG6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmem47Q9JJG6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmem47Q9JJG6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmem47Q9JJG6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmem47Q9JJG6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmem47Q9JJG6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmem47Q9JJG6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmem47Q9JJG6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmem47Q9JJG6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmem47Q9JJG6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmem47Q9JJG6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmem47Q9JJG6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmem47Q9JJG6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmem47Q9JJG6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmem47Q9JJG6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmem47Q9JJG6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmem47Q9JJG6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmem47Q9JJG6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmem47Q9JJG6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmem47Q9JJG6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmem47Q9JJG6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmem47Q9JJG6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmem47Q9JJG6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmem47Q9JJG6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmem47Q9JJG6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmem47Q9JJG6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmem47Q9JJG6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmem47Q9JJG6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmem47Q9JJG6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmem47Q9JJG6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmem47Q9JJG6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmem47Q9JJG6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmem47Q9JJG6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmem47Q9JJG6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmem47Q9JJG6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmem47Q9JJG6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmem47Q9JJG6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmem47Q9JJG6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmem47Q9JJG6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmem47Q9JJG6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmem47Q9JJG6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmem47Q9JJG6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmem47Q9JJG6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmem47Q9JJG6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmem47Q9JJG6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmem47Q9JJG6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmem47Q9JJG6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tmem47Q9JJG6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmem47Q9JJG6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmem47Q9JJG6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmem47Q9JJG6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmem47Q9JJG6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmem47Q9JJG6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmem47Q9JJG6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmem47Q9JJG6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmem47Q9JJG6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmem47Q9JJG6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmem47Q9JJG6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmem47Q9JJG6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmem47Q9JJG6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmem47Q9JJG6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmem47Q9JJG6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmem47Q9JJG6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmem47Q9JJG6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmem47Q9JJG6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmem47Q9JJG6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmem47Q9JJG6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmem47Q9JJG6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmem47Q9JJG6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmem47Q9JJG6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmem47Q9JJG6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmem47Q9JJG6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmem47Q9JJG6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmem47Q9JJG6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmem47Q9JJG6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmem47Q9JJG6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmem47Q9JJG6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmem47Q9JJG6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmem47Q9JJG6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmem47Q9JJG6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmem47Q9JJG6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms