Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI99

Sgpp1, Sphingosine-1-phosphate phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgpp1Q9JI99 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sgpp1Q9JI99 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sgpp1Q9JI99 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sgpp1Q9JI99 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sgpp1Q9JI99 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sgpp1Q9JI99 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sgpp1Q9JI99 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sgpp1Q9JI99 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sgpp1Q9JI99 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sgpp1Q9JI99 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sgpp1Q9JI99 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sgpp1Q9JI99 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sgpp1Q9JI99 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sgpp1Q9JI99 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sgpp1Q9JI99 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Sgpp1Q9JI99 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sgpp1Q9JI99 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sgpp1Q9JI99 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sgpp1Q9JI99 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sgpp1Q9JI99 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sgpp1Q9JI99 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sgpp1Q9JI99 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sgpp1Q9JI99 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sgpp1Q9JI99 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Sgpp1Q9JI99 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sgpp1Q9JI99 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sgpp1Q9JI99 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Sgpp1Q9JI99 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sgpp1Q9JI99 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sgpp1Q9JI99 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sgpp1Q9JI99 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sgpp1Q9JI99 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sgpp1Q9JI99 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sgpp1Q9JI99 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sgpp1Q9JI99 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sgpp1Q9JI99 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sgpp1Q9JI99 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sgpp1Q9JI99 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sgpp1Q9JI99 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sgpp1Q9JI99 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sgpp1Q9JI99 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sgpp1Q9JI99 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sgpp1Q9JI99 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sgpp1Q9JI99 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sgpp1Q9JI99 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sgpp1Q9JI99 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sgpp1Q9JI99 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sgpp1Q9JI99 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sgpp1Q9JI99 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sgpp1Q9JI99 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sgpp1Q9JI99 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sgpp1Q9JI99 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sgpp1Q9JI99 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Sgpp1Q9JI99 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sgpp1Q9JI99 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sgpp1Q9JI99 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sgpp1Q9JI99 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sgpp1Q9JI99 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sgpp1Q9JI99 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sgpp1Q9JI99 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Sgpp1Q9JI99 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sgpp1Q9JI99 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sgpp1Q9JI99 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sgpp1Q9JI99 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sgpp1Q9JI99 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sgpp1Q9JI99 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sgpp1Q9JI99 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sgpp1Q9JI99 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sgpp1Q9JI99 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sgpp1Q9JI99 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sgpp1Q9JI99 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sgpp1Q9JI99 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sgpp1Q9JI99 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sgpp1Q9JI99 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sgpp1Q9JI99 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sgpp1Q9JI99 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sgpp1Q9JI99 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sgpp1Q9JI99 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sgpp1Q9JI99 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sgpp1Q9JI99 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sgpp1Q9JI99 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sgpp1Q9JI99 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sgpp1Q9JI99 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sgpp1Q9JI99 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sgpp1Q9JI99 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sgpp1Q9JI99 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sgpp1Q9JI99 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sgpp1Q9JI99 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sgpp1Q9JI99 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sgpp1Q9JI99 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sgpp1Q9JI99 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sgpp1Q9JI99 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sgpp1Q9JI99 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sgpp1Q9JI99 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sgpp1Q9JI99 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sgpp1Q9JI99 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sgpp1Q9JI99 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Sgpp1Q9JI99 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sgpp1Q9JI99 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Sgpp1Q9JI99 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms