Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2ird1Q9JI57 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2ird1Q9JI57 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2ird1Q9JI57 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2ird1Q9JI57 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2ird1Q9JI57 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2ird1Q9JI57 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2ird1Q9JI57 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2ird1Q9JI57 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2ird1Q9JI57 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2ird1Q9JI57 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2ird1Q9JI57 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2ird1Q9JI57 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2ird1Q9JI57 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2ird1Q9JI57 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2ird1Q9JI57 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2ird1Q9JI57 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2ird1Q9JI57 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2ird1Q9JI57 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2ird1Q9JI57 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2ird1Q9JI57 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2ird1Q9JI57 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2ird1Q9JI57 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2ird1Q9JI57 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2ird1Q9JI57 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2ird1Q9JI57 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf2ird1Q9JI57 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf2ird1Q9JI57 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf2ird1Q9JI57 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf2ird1Q9JI57 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf2ird1Q9JI57 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf2ird1Q9JI57 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gtf2ird1Q9JI57 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf2ird1Q9JI57 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf2ird1Q9JI57 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf2ird1Q9JI57 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf2ird1Q9JI57 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf2ird1Q9JI57 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2ird1Q9JI57 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2ird1Q9JI57 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2ird1Q9JI57 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2ird1Q9JI57 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2ird1Q9JI57 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2ird1Q9JI57 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2ird1Q9JI57 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2ird1Q9JI57 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2ird1Q9JI57 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2ird1Q9JI57 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2ird1Q9JI57 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf2ird1Q9JI57 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf2ird1Q9JI57 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf2ird1Q9JI57 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf2ird1Q9JI57 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf2ird1Q9JI57 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf2ird1Q9JI57 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf2ird1Q9JI57 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf2ird1Q9JI57 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf2ird1Q9JI57 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf2ird1Q9JI57 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf2ird1Q9JI57 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf2ird1Q9JI57 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf2ird1Q9JI57 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf2ird1Q9JI57 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gtf2ird1Q9JI57 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gtf2ird1Q9JI57 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf2ird1Q9JI57 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf2ird1Q9JI57 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf2ird1Q9JI57 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf2ird1Q9JI57 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf2ird1Q9JI57 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf2ird1Q9JI57 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf2ird1Q9JI57 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf2ird1Q9JI57 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2ird1Q9JI57 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2ird1Q9JI57 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2ird1Q9JI57 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2ird1Q9JI57 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2ird1Q9JI57 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2ird1Q9JI57 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2ird1Q9JI57 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2ird1Q9JI57 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2ird1Q9JI57 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2ird1Q9JI57 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2ird1Q9JI57 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2ird1Q9JI57 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2ird1Q9JI57 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2ird1Q9JI57 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2ird1Q9JI57 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2ird1Q9JI57 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2ird1Q9JI57 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2ird1Q9JI57 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2ird1Q9JI57 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2ird1Q9JI57 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2ird1Q9JI57 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2ird1Q9JI57 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2ird1Q9JI57 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2ird1Q9JI57 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms