Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ5

Htr3b, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3bQ9JHJ5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Htr3bQ9JHJ5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Htr3bQ9JHJ5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Htr3bQ9JHJ5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Htr3bQ9JHJ5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Htr3bQ9JHJ5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Htr3bQ9JHJ5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Htr3bQ9JHJ5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Htr3bQ9JHJ5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Htr3bQ9JHJ5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Htr3bQ9JHJ5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Htr3bQ9JHJ5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Htr3bQ9JHJ5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Htr3bQ9JHJ5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Htr3bQ9JHJ5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Htr3bQ9JHJ5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Htr3bQ9JHJ5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Htr3bQ9JHJ5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Htr3bQ9JHJ5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Htr3bQ9JHJ5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Htr3bQ9JHJ5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Htr3bQ9JHJ5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Htr3bQ9JHJ5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Htr3bQ9JHJ5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Htr3bQ9JHJ5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Htr3bQ9JHJ5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Htr3bQ9JHJ5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Htr3bQ9JHJ5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Htr3bQ9JHJ5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Htr3bQ9JHJ5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Htr3bQ9JHJ5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Htr3bQ9JHJ5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Htr3bQ9JHJ5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Htr3bQ9JHJ5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Htr3bQ9JHJ5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Htr3bQ9JHJ5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Htr3bQ9JHJ5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Htr3bQ9JHJ5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Htr3bQ9JHJ5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Htr3bQ9JHJ5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Htr3bQ9JHJ5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Htr3bQ9JHJ5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Htr3bQ9JHJ5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Htr3bQ9JHJ5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Htr3bQ9JHJ5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Htr3bQ9JHJ5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Htr3bQ9JHJ5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Htr3bQ9JHJ5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Htr3bQ9JHJ5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Htr3bQ9JHJ5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Htr3bQ9JHJ5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Htr3bQ9JHJ5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Htr3bQ9JHJ5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Htr3bQ9JHJ5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Htr3bQ9JHJ5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Htr3bQ9JHJ5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Htr3bQ9JHJ5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Htr3bQ9JHJ5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Htr3bQ9JHJ5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Htr3bQ9JHJ5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Htr3bQ9JHJ5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Htr3bQ9JHJ5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Htr3bQ9JHJ5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Htr3bQ9JHJ5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Htr3bQ9JHJ5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Htr3bQ9JHJ5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Htr3bQ9JHJ5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Htr3bQ9JHJ5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Htr3bQ9JHJ5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Htr3bQ9JHJ5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Htr3bQ9JHJ5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Htr3bQ9JHJ5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Htr3bQ9JHJ5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Htr3bQ9JHJ5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Htr3bQ9JHJ5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Htr3bQ9JHJ5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Htr3bQ9JHJ5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Htr3bQ9JHJ5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Htr3bQ9JHJ5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Htr3bQ9JHJ5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Htr3bQ9JHJ5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Htr3bQ9JHJ5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Htr3bQ9JHJ5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Htr3bQ9JHJ5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Htr3bQ9JHJ5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Htr3bQ9JHJ5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Htr3bQ9JHJ5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Htr3bQ9JHJ5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Htr3bQ9JHJ5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Htr3bQ9JHJ5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Htr3bQ9JHJ5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Htr3bQ9JHJ5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Htr3bQ9JHJ5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Htr3bQ9JHJ5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Htr3bQ9JHJ5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Htr3bQ9JHJ5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Htr3bQ9JHJ5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Htr3bQ9JHJ5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Htr3bQ9JHJ5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Htr3bQ9JHJ5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms