Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI9

Slc40a1, Solute carrier family 40 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc40a1Q9JHI9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc40a1Q9JHI9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc40a1Q9JHI9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc40a1Q9JHI9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc40a1Q9JHI9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc40a1Q9JHI9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc40a1Q9JHI9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc40a1Q9JHI9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc40a1Q9JHI9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc40a1Q9JHI9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc40a1Q9JHI9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc40a1Q9JHI9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc40a1Q9JHI9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc40a1Q9JHI9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc40a1Q9JHI9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc40a1Q9JHI9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc40a1Q9JHI9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc40a1Q9JHI9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc40a1Q9JHI9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc40a1Q9JHI9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc40a1Q9JHI9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc40a1Q9JHI9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc40a1Q9JHI9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc40a1Q9JHI9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc40a1Q9JHI9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc40a1Q9JHI9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc40a1Q9JHI9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc40a1Q9JHI9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc40a1Q9JHI9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc40a1Q9JHI9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc40a1Q9JHI9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc40a1Q9JHI9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc40a1Q9JHI9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc40a1Q9JHI9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc40a1Q9JHI9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc40a1Q9JHI9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc40a1Q9JHI9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc40a1Q9JHI9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc40a1Q9JHI9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc40a1Q9JHI9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc40a1Q9JHI9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc40a1Q9JHI9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc40a1Q9JHI9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc40a1Q9JHI9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc40a1Q9JHI9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc40a1Q9JHI9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc40a1Q9JHI9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc40a1Q9JHI9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc40a1Q9JHI9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc40a1Q9JHI9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc40a1Q9JHI9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc40a1Q9JHI9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc40a1Q9JHI9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc40a1Q9JHI9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc40a1Q9JHI9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc40a1Q9JHI9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc40a1Q9JHI9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc40a1Q9JHI9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc40a1Q9JHI9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc40a1Q9JHI9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc40a1Q9JHI9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc40a1Q9JHI9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc40a1Q9JHI9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc40a1Q9JHI9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc40a1Q9JHI9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc40a1Q9JHI9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc40a1Q9JHI9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc40a1Q9JHI9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc40a1Q9JHI9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc40a1Q9JHI9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc40a1Q9JHI9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc40a1Q9JHI9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc40a1Q9JHI9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc40a1Q9JHI9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc40a1Q9JHI9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc40a1Q9JHI9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc40a1Q9JHI9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc40a1Q9JHI9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc40a1Q9JHI9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc40a1Q9JHI9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc40a1Q9JHI9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc40a1Q9JHI9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc40a1Q9JHI9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc40a1Q9JHI9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc40a1Q9JHI9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc40a1Q9JHI9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc40a1Q9JHI9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc40a1Q9JHI9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc40a1Q9JHI9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc40a1Q9JHI9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc40a1Q9JHI9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc40a1Q9JHI9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc40a1Q9JHI9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc40a1Q9JHI9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc40a1Q9JHI9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc40a1Q9JHI9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc40a1Q9JHI9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc40a1Q9JHI9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc40a1Q9JHI9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc40a1Q9JHI9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms