Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK3

Capn10, Calpain-10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn10Q9ESK3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Capn10Q9ESK3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Capn10Q9ESK3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Capn10Q9ESK3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Capn10Q9ESK3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Capn10Q9ESK3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Capn10Q9ESK3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Capn10Q9ESK3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Capn10Q9ESK3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Capn10Q9ESK3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Capn10Q9ESK3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Capn10Q9ESK3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Capn10Q9ESK3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Capn10Q9ESK3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Capn10Q9ESK3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Capn10Q9ESK3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Capn10Q9ESK3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Capn10Q9ESK3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Capn10Q9ESK3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Capn10Q9ESK3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Capn10Q9ESK3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Capn10Q9ESK3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Capn10Q9ESK3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Capn10Q9ESK3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Capn10Q9ESK3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Capn10Q9ESK3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Capn10Q9ESK3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Capn10Q9ESK3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Capn10Q9ESK3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Capn10Q9ESK3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Capn10Q9ESK3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Capn10Q9ESK3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Capn10Q9ESK3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Capn10Q9ESK3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Capn10Q9ESK3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Capn10Q9ESK3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Capn10Q9ESK3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Capn10Q9ESK3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Capn10Q9ESK3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Capn10Q9ESK3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Capn10Q9ESK3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Capn10Q9ESK3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Capn10Q9ESK3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Capn10Q9ESK3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Capn10Q9ESK3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Capn10Q9ESK3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Capn10Q9ESK3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Capn10Q9ESK3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Capn10Q9ESK3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Capn10Q9ESK3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Capn10Q9ESK3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Capn10Q9ESK3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Capn10Q9ESK3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Capn10Q9ESK3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Capn10Q9ESK3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Capn10Q9ESK3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Capn10Q9ESK3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Capn10Q9ESK3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Capn10Q9ESK3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Capn10Q9ESK3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Capn10Q9ESK3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Capn10Q9ESK3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Capn10Q9ESK3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Capn10Q9ESK3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capn10Q9ESK3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capn10Q9ESK3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capn10Q9ESK3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capn10Q9ESK3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capn10Q9ESK3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Capn10Q9ESK3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Capn10Q9ESK3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Capn10Q9ESK3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Capn10Q9ESK3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Capn10Q9ESK3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Capn10Q9ESK3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Capn10Q9ESK3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Capn10Q9ESK3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Capn10Q9ESK3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Capn10Q9ESK3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Capn10Q9ESK3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Capn10Q9ESK3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Capn10Q9ESK3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Capn10Q9ESK3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Capn10Q9ESK3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Capn10Q9ESK3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Capn10Q9ESK3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Capn10Q9ESK3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Capn10Q9ESK3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Capn10Q9ESK3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Capn10Q9ESK3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Capn10Q9ESK3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Capn10Q9ESK3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Capn10Q9ESK3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Capn10Q9ESK3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Capn10Q9ESK3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Capn10Q9ESK3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Capn10Q9ESK3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Capn10Q9ESK3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Capn10Q9ESK3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capn10Q9ESK3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms