Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG0

Lima1, LIM domain and actin-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lima1Q9ERG0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lima1Q9ERG0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lima1Q9ERG0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lima1Q9ERG0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lima1Q9ERG0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lima1Q9ERG0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lima1Q9ERG0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lima1Q9ERG0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lima1Q9ERG0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lima1Q9ERG0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lima1Q9ERG0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lima1Q9ERG0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lima1Q9ERG0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lima1Q9ERG0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lima1Q9ERG0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lima1Q9ERG0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lima1Q9ERG0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lima1Q9ERG0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lima1Q9ERG0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lima1Q9ERG0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lima1Q9ERG0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lima1Q9ERG0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lima1Q9ERG0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lima1Q9ERG0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lima1Q9ERG0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lima1Q9ERG0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lima1Q9ERG0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lima1Q9ERG0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lima1Q9ERG0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lima1Q9ERG0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lima1Q9ERG0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lima1Q9ERG0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lima1Q9ERG0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lima1Q9ERG0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lima1Q9ERG0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lima1Q9ERG0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lima1Q9ERG0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lima1Q9ERG0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lima1Q9ERG0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lima1Q9ERG0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lima1Q9ERG0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lima1Q9ERG0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lima1Q9ERG0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lima1Q9ERG0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lima1Q9ERG0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lima1Q9ERG0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lima1Q9ERG0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lima1Q9ERG0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lima1Q9ERG0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lima1Q9ERG0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lima1Q9ERG0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lima1Q9ERG0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lima1Q9ERG0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lima1Q9ERG0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lima1Q9ERG0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lima1Q9ERG0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lima1Q9ERG0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lima1Q9ERG0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lima1Q9ERG0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lima1Q9ERG0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lima1Q9ERG0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lima1Q9ERG0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lima1Q9ERG0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lima1Q9ERG0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lima1Q9ERG0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lima1Q9ERG0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lima1Q9ERG0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lima1Q9ERG0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lima1Q9ERG0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lima1Q9ERG0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lima1Q9ERG0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lima1Q9ERG0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lima1Q9ERG0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lima1Q9ERG0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lima1Q9ERG0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lima1Q9ERG0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lima1Q9ERG0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lima1Q9ERG0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lima1Q9ERG0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lima1Q9ERG0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lima1Q9ERG0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lima1Q9ERG0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lima1Q9ERG0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lima1Q9ERG0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lima1Q9ERG0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lima1Q9ERG0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lima1Q9ERG0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lima1Q9ERG0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lima1Q9ERG0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lima1Q9ERG0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lima1Q9ERG0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lima1Q9ERG0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lima1Q9ERG0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lima1Q9ERG0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lima1Q9ERG0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lima1Q9ERG0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lima1Q9ERG0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Lima1Q9ERG0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lima1Q9ERG0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Lima1Q9ERG0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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