Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Irx6Q9ER75 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Irx6Q9ER75 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Irx6Q9ER75 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Irx6Q9ER75 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Irx6Q9ER75 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Irx6Q9ER75 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Irx6Q9ER75 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Irx6Q9ER75 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Irx6Q9ER75 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Irx6Q9ER75 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Irx6Q9ER75 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Irx6Q9ER75 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Irx6Q9ER75 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Irx6Q9ER75 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Irx6Q9ER75 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Irx6Q9ER75 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Irx6Q9ER75 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Irx6Q9ER75 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Irx6Q9ER75 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Irx6Q9ER75 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Irx6Q9ER75 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Irx6Q9ER75 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Irx6Q9ER75 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Irx6Q9ER75 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Irx6Q9ER75 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Irx6Q9ER75 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Irx6Q9ER75 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Irx6Q9ER75 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Irx6Q9ER75 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Irx6Q9ER75 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Irx6Q9ER75 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Irx6Q9ER75 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Irx6Q9ER75 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Irx6Q9ER75 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Irx6Q9ER75 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Irx6Q9ER75 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Irx6Q9ER75 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Irx6Q9ER75 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Irx6Q9ER75 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Irx6Q9ER75 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Irx6Q9ER75 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Irx6Q9ER75 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Irx6Q9ER75 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Irx6Q9ER75 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Irx6Q9ER75 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Irx6Q9ER75 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Irx6Q9ER75 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Irx6Q9ER75 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Irx6Q9ER75 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Irx6Q9ER75 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Irx6Q9ER75 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Irx6Q9ER75 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Irx6Q9ER75 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Irx6Q9ER75 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Irx6Q9ER75 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Irx6Q9ER75 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Irx6Q9ER75 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Irx6Q9ER75 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Irx6Q9ER75 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Irx6Q9ER75 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Irx6Q9ER75 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Irx6Q9ER75 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Irx6Q9ER75 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Irx6Q9ER75 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Irx6Q9ER75 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Irx6Q9ER75 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Irx6Q9ER75 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Irx6Q9ER75 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Irx6Q9ER75 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Irx6Q9ER75 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Irx6Q9ER75 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Irx6Q9ER75 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Irx6Q9ER75 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Irx6Q9ER75 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Irx6Q9ER75 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Irx6Q9ER75 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Irx6Q9ER75 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Irx6Q9ER75 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Irx6Q9ER75 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Irx6Q9ER75 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Irx6Q9ER75 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Irx6Q9ER75 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Irx6Q9ER75 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Irx6Q9ER75 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Irx6Q9ER75 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Irx6Q9ER75 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Irx6Q9ER75 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Irx6Q9ER75 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Irx6Q9ER75 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Irx6Q9ER75 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Irx6Q9ER75 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Irx6Q9ER75 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Irx6Q9ER75 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Irx6Q9ER75 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Irx6Q9ER75 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Irx6Q9ER75 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Irx6Q9ER75 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Irx6Q9ER75 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Irx6Q9ER75 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms