Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER41

Tor1b, Torsin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tor1bQ9ER41 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tor1bQ9ER41 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tor1bQ9ER41 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tor1bQ9ER41 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tor1bQ9ER41 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tor1bQ9ER41 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tor1bQ9ER41 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tor1bQ9ER41 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tor1bQ9ER41 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tor1bQ9ER41 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tor1bQ9ER41 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tor1bQ9ER41 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tor1bQ9ER41 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tor1bQ9ER41 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tor1bQ9ER41 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tor1bQ9ER41 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tor1bQ9ER41 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tor1bQ9ER41 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tor1bQ9ER41 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tor1bQ9ER41 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tor1bQ9ER41 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tor1bQ9ER41 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tor1bQ9ER41 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tor1bQ9ER41 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tor1bQ9ER41 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tor1bQ9ER41 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tor1bQ9ER41 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tor1bQ9ER41 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tor1bQ9ER41 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tor1bQ9ER41 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tor1bQ9ER41 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tor1bQ9ER41 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tor1bQ9ER41 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tor1bQ9ER41 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tor1bQ9ER41 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tor1bQ9ER41 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tor1bQ9ER41 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tor1bQ9ER41 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tor1bQ9ER41 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tor1bQ9ER41 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tor1bQ9ER41 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tor1bQ9ER41 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tor1bQ9ER41 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tor1bQ9ER41 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tor1bQ9ER41 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tor1bQ9ER41 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tor1bQ9ER41 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tor1bQ9ER41 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tor1bQ9ER41 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tor1bQ9ER41 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tor1bQ9ER41 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tor1bQ9ER41 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tor1bQ9ER41 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tor1bQ9ER41 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tor1bQ9ER41 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tor1bQ9ER41 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tor1bQ9ER41 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tor1bQ9ER41 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tor1bQ9ER41 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tor1bQ9ER41 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tor1bQ9ER41 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tor1bQ9ER41 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tor1bQ9ER41 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tor1bQ9ER41 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tor1bQ9ER41 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tor1bQ9ER41 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tor1bQ9ER41 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tor1bQ9ER41 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tor1bQ9ER41 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tor1bQ9ER41 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tor1bQ9ER41 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tor1bQ9ER41 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tor1bQ9ER41 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tor1bQ9ER41 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tor1bQ9ER41 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tor1bQ9ER41 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tor1bQ9ER41 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tor1bQ9ER41 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tor1bQ9ER41 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tor1bQ9ER41 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tor1bQ9ER41 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tor1bQ9ER41 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tor1bQ9ER41 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tor1bQ9ER41 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tor1bQ9ER41 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tor1bQ9ER41 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tor1bQ9ER41 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tor1bQ9ER41 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tor1bQ9ER41 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tor1bQ9ER41 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tor1bQ9ER41 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tor1bQ9ER41 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tor1bQ9ER41 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tor1bQ9ER41 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tor1bQ9ER41 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tor1bQ9ER41 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tor1bQ9ER41 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tor1bQ9ER41 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tor1bQ9ER41 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tor1bQ9ER41 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms