Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH3

Vps35, Vacuolar protein sorting-associated protein 35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps35Q9EQH3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps35Q9EQH3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps35Q9EQH3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps35Q9EQH3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps35Q9EQH3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps35Q9EQH3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps35Q9EQH3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps35Q9EQH3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps35Q9EQH3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps35Q9EQH3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps35Q9EQH3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps35Q9EQH3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps35Q9EQH3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps35Q9EQH3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps35Q9EQH3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps35Q9EQH3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps35Q9EQH3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps35Q9EQH3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps35Q9EQH3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps35Q9EQH3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps35Q9EQH3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps35Q9EQH3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps35Q9EQH3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps35Q9EQH3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vps35Q9EQH3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vps35Q9EQH3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vps35Q9EQH3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vps35Q9EQH3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vps35Q9EQH3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vps35Q9EQH3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vps35Q9EQH3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vps35Q9EQH3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vps35Q9EQH3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vps35Q9EQH3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vps35Q9EQH3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vps35Q9EQH3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vps35Q9EQH3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps35Q9EQH3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps35Q9EQH3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps35Q9EQH3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps35Q9EQH3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps35Q9EQH3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps35Q9EQH3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps35Q9EQH3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps35Q9EQH3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps35Q9EQH3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps35Q9EQH3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps35Q9EQH3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps35Q9EQH3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps35Q9EQH3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps35Q9EQH3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps35Q9EQH3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps35Q9EQH3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps35Q9EQH3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps35Q9EQH3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps35Q9EQH3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps35Q9EQH3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps35Q9EQH3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps35Q9EQH3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vps35Q9EQH3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vps35Q9EQH3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vps35Q9EQH3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Vps35Q9EQH3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps35Q9EQH3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps35Q9EQH3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps35Q9EQH3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps35Q9EQH3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps35Q9EQH3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps35Q9EQH3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps35Q9EQH3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps35Q9EQH3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps35Q9EQH3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps35Q9EQH3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps35Q9EQH3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps35Q9EQH3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps35Q9EQH3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps35Q9EQH3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps35Q9EQH3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps35Q9EQH3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps35Q9EQH3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps35Q9EQH3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps35Q9EQH3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps35Q9EQH3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps35Q9EQH3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps35Q9EQH3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vps35Q9EQH3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vps35Q9EQH3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vps35Q9EQH3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vps35Q9EQH3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps35Q9EQH3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps35Q9EQH3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps35Q9EQH3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps35Q9EQH3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps35Q9EQH3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps35Q9EQH3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps35Q9EQH3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vps35Q9EQH3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vps35Q9EQH3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vps35Q9EQH3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Vps35Q9EQH3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms