Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ48

V1ra8, Vomeronasal type-1 receptor A8, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1ra8Q9EQ48 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
V1ra8Q9EQ48 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
V1ra8Q9EQ48 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
V1ra8Q9EQ48 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
V1ra8Q9EQ48 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
V1ra8Q9EQ48 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
V1ra8Q9EQ48 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
V1ra8Q9EQ48 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
V1ra8Q9EQ48 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
V1ra8Q9EQ48 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
V1ra8Q9EQ48 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
V1ra8Q9EQ48 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
V1ra8Q9EQ48 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
V1ra8Q9EQ48 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
V1ra8Q9EQ48 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
V1ra8Q9EQ48 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
V1ra8Q9EQ48 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
V1ra8Q9EQ48 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
V1ra8Q9EQ48 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
V1ra8Q9EQ48 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
V1ra8Q9EQ48 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
V1ra8Q9EQ48 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
V1ra8Q9EQ48 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
V1ra8Q9EQ48 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
V1ra8Q9EQ48 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
V1ra8Q9EQ48 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
V1ra8Q9EQ48 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
V1ra8Q9EQ48 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
V1ra8Q9EQ48 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
V1ra8Q9EQ48 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
V1ra8Q9EQ48 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
V1ra8Q9EQ48 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
V1ra8Q9EQ48 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
V1ra8Q9EQ48 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
V1ra8Q9EQ48 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
V1ra8Q9EQ48 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
V1ra8Q9EQ48 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
V1ra8Q9EQ48 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
V1ra8Q9EQ48 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
V1ra8Q9EQ48 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
V1ra8Q9EQ48 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
V1ra8Q9EQ48 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
V1ra8Q9EQ48 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
V1ra8Q9EQ48 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
V1ra8Q9EQ48 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
V1ra8Q9EQ48 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
V1ra8Q9EQ48 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
V1ra8Q9EQ48 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
V1ra8Q9EQ48 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
V1ra8Q9EQ48 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182.5 ms