Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPC5

Rbp7, Retinoid-binding protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp7Q9EPC5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbp7Q9EPC5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbp7Q9EPC5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbp7Q9EPC5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbp7Q9EPC5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbp7Q9EPC5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbp7Q9EPC5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbp7Q9EPC5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbp7Q9EPC5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbp7Q9EPC5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbp7Q9EPC5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbp7Q9EPC5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbp7Q9EPC5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbp7Q9EPC5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbp7Q9EPC5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbp7Q9EPC5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbp7Q9EPC5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbp7Q9EPC5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbp7Q9EPC5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbp7Q9EPC5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbp7Q9EPC5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rbp7Q9EPC5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rbp7Q9EPC5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rbp7Q9EPC5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbp7Q9EPC5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbp7Q9EPC5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbp7Q9EPC5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbp7Q9EPC5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbp7Q9EPC5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbp7Q9EPC5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbp7Q9EPC5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbp7Q9EPC5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbp7Q9EPC5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbp7Q9EPC5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbp7Q9EPC5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbp7Q9EPC5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbp7Q9EPC5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbp7Q9EPC5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbp7Q9EPC5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbp7Q9EPC5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbp7Q9EPC5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbp7Q9EPC5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbp7Q9EPC5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbp7Q9EPC5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbp7Q9EPC5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbp7Q9EPC5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbp7Q9EPC5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbp7Q9EPC5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbp7Q9EPC5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbp7Q9EPC5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbp7Q9EPC5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rbp7Q9EPC5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rbp7Q9EPC5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rbp7Q9EPC5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rbp7Q9EPC5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rbp7Q9EPC5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rbp7Q9EPC5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbp7Q9EPC5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbp7Q9EPC5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbp7Q9EPC5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbp7Q9EPC5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbp7Q9EPC5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbp7Q9EPC5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbp7Q9EPC5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbp7Q9EPC5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbp7Q9EPC5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbp7Q9EPC5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbp7Q9EPC5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbp7Q9EPC5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbp7Q9EPC5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbp7Q9EPC5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbp7Q9EPC5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbp7Q9EPC5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbp7Q9EPC5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbp7Q9EPC5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbp7Q9EPC5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbp7Q9EPC5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbp7Q9EPC5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbp7Q9EPC5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbp7Q9EPC5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbp7Q9EPC5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbp7Q9EPC5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbp7Q9EPC5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbp7Q9EPC5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbp7Q9EPC5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbp7Q9EPC5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbp7Q9EPC5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbp7Q9EPC5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rbp7Q9EPC5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbp7Q9EPC5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbp7Q9EPC5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbp7Q9EPC5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbp7Q9EPC5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbp7Q9EPC5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbp7Q9EPC5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbp7Q9EPC5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbp7Q9EPC5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbp7Q9EPC5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbp7Q9EPC5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbp7Q9EPC5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms