Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp2aQ9DB34 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp2aQ9DB34 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp2aQ9DB34 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp2aQ9DB34 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp2aQ9DB34 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp2aQ9DB34 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp2aQ9DB34 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp2aQ9DB34 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp2aQ9DB34 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp2aQ9DB34 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp2aQ9DB34 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp2aQ9DB34 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp2aQ9DB34 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp2aQ9DB34 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp2aQ9DB34 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp2aQ9DB34 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp2aQ9DB34 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp2aQ9DB34 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp2aQ9DB34 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp2aQ9DB34 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp2aQ9DB34 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp2aQ9DB34 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp2aQ9DB34 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp2aQ9DB34 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp2aQ9DB34 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp2aQ9DB34 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp2aQ9DB34 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp2aQ9DB34 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp2aQ9DB34 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp2aQ9DB34 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp2aQ9DB34 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp2aQ9DB34 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp2aQ9DB34 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp2aQ9DB34 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp2aQ9DB34 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp2aQ9DB34 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp2aQ9DB34 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp2aQ9DB34 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp2aQ9DB34 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp2aQ9DB34 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp2aQ9DB34 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp2aQ9DB34 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp2aQ9DB34 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp2aQ9DB34 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp2aQ9DB34 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp2aQ9DB34 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp2aQ9DB34 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp2aQ9DB34 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp2aQ9DB34 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp2aQ9DB34 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp2aQ9DB34 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp2aQ9DB34 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Chmp2aQ9DB34 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp2aQ9DB34 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp2aQ9DB34 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp2aQ9DB34 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp2aQ9DB34 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp2aQ9DB34 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp2aQ9DB34 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp2aQ9DB34 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp2aQ9DB34 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp2aQ9DB34 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp2aQ9DB34 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp2aQ9DB34 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp2aQ9DB34 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp2aQ9DB34 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp2aQ9DB34 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp2aQ9DB34 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp2aQ9DB34 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp2aQ9DB34 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp2aQ9DB34 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp2aQ9DB34 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp2aQ9DB34 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp2aQ9DB34 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp2aQ9DB34 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp2aQ9DB34 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp2aQ9DB34 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp2aQ9DB34 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp2aQ9DB34 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp2aQ9DB34 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp2aQ9DB34 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp2aQ9DB34 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp2aQ9DB34 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp2aQ9DB34 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp2aQ9DB34 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp2aQ9DB34 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp2aQ9DB34 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp2aQ9DB34 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp2aQ9DB34 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chmp2aQ9DB34 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Chmp2aQ9DB34 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chmp2aQ9DB34 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chmp2aQ9DB34 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chmp2aQ9DB34 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chmp2aQ9DB34 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chmp2aQ9DB34 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chmp2aQ9DB34 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp2aQ9DB34 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp2aQ9DB34 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms