Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAC0

Cmtm2b, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2bQ9DAC0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cmtm2bQ9DAC0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cmtm2bQ9DAC0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cmtm2bQ9DAC0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cmtm2bQ9DAC0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cmtm2bQ9DAC0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cmtm2bQ9DAC0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cmtm2bQ9DAC0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cmtm2bQ9DAC0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cmtm2bQ9DAC0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cmtm2bQ9DAC0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cmtm2bQ9DAC0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cmtm2bQ9DAC0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cmtm2bQ9DAC0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cmtm2bQ9DAC0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cmtm2bQ9DAC0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cmtm2bQ9DAC0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cmtm2bQ9DAC0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cmtm2bQ9DAC0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cmtm2bQ9DAC0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cmtm2bQ9DAC0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cmtm2bQ9DAC0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cmtm2bQ9DAC0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cmtm2bQ9DAC0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cmtm2bQ9DAC0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cmtm2bQ9DAC0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cmtm2bQ9DAC0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cmtm2bQ9DAC0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cmtm2bQ9DAC0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cmtm2bQ9DAC0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cmtm2bQ9DAC0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cmtm2bQ9DAC0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cmtm2bQ9DAC0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cmtm2bQ9DAC0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cmtm2bQ9DAC0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cmtm2bQ9DAC0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cmtm2bQ9DAC0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cmtm2bQ9DAC0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cmtm2bQ9DAC0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cmtm2bQ9DAC0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cmtm2bQ9DAC0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cmtm2bQ9DAC0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cmtm2bQ9DAC0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cmtm2bQ9DAC0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cmtm2bQ9DAC0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cmtm2bQ9DAC0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cmtm2bQ9DAC0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cmtm2bQ9DAC0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cmtm2bQ9DAC0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cmtm2bQ9DAC0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cmtm2bQ9DAC0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cmtm2bQ9DAC0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cmtm2bQ9DAC0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cmtm2bQ9DAC0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cmtm2bQ9DAC0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cmtm2bQ9DAC0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cmtm2bQ9DAC0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cmtm2bQ9DAC0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cmtm2bQ9DAC0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cmtm2bQ9DAC0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cmtm2bQ9DAC0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmtm2bQ9DAC0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmtm2bQ9DAC0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmtm2bQ9DAC0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmtm2bQ9DAC0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmtm2bQ9DAC0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmtm2bQ9DAC0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmtm2bQ9DAC0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmtm2bQ9DAC0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmtm2bQ9DAC0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cmtm2bQ9DAC0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cmtm2bQ9DAC0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cmtm2bQ9DAC0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cmtm2bQ9DAC0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cmtm2bQ9DAC0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cmtm2bQ9DAC0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cmtm2bQ9DAC0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cmtm2bQ9DAC0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cmtm2bQ9DAC0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cmtm2bQ9DAC0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cmtm2bQ9DAC0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cmtm2bQ9DAC0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cmtm2bQ9DAC0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmtm2bQ9DAC0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmtm2bQ9DAC0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmtm2bQ9DAC0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmtm2bQ9DAC0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmtm2bQ9DAC0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmtm2bQ9DAC0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmtm2bQ9DAC0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmtm2bQ9DAC0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmtm2bQ9DAC0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmtm2bQ9DAC0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmtm2bQ9DAC0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmtm2bQ9DAC0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmtm2bQ9DAC0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmtm2bQ9DAC0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms