Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp12Q9D9M2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp12Q9D9M2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp12Q9D9M2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp12Q9D9M2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp12Q9D9M2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp12Q9D9M2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp12Q9D9M2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp12Q9D9M2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp12Q9D9M2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp12Q9D9M2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp12Q9D9M2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp12Q9D9M2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp12Q9D9M2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp12Q9D9M2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp12Q9D9M2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp12Q9D9M2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp12Q9D9M2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp12Q9D9M2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp12Q9D9M2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Usp12Q9D9M2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp12Q9D9M2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp12Q9D9M2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp12Q9D9M2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp12Q9D9M2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp12Q9D9M2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp12Q9D9M2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp12Q9D9M2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp12Q9D9M2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp12Q9D9M2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp12Q9D9M2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp12Q9D9M2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp12Q9D9M2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp12Q9D9M2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp12Q9D9M2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp12Q9D9M2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp12Q9D9M2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp12Q9D9M2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp12Q9D9M2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp12Q9D9M2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp12Q9D9M2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp12Q9D9M2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp12Q9D9M2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp12Q9D9M2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp12Q9D9M2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp12Q9D9M2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp12Q9D9M2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp12Q9D9M2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp12Q9D9M2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp12Q9D9M2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp12Q9D9M2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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