Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9I4

Tbc1d20, TBC1 domain family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d20Q9D9I4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d20Q9D9I4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d20Q9D9I4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d20Q9D9I4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d20Q9D9I4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d20Q9D9I4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d20Q9D9I4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d20Q9D9I4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d20Q9D9I4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d20Q9D9I4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d20Q9D9I4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d20Q9D9I4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d20Q9D9I4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d20Q9D9I4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d20Q9D9I4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d20Q9D9I4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d20Q9D9I4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d20Q9D9I4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d20Q9D9I4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d20Q9D9I4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tbc1d20Q9D9I4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tbc1d20Q9D9I4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tbc1d20Q9D9I4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tbc1d20Q9D9I4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbc1d20Q9D9I4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbc1d20Q9D9I4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbc1d20Q9D9I4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbc1d20Q9D9I4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbc1d20Q9D9I4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbc1d20Q9D9I4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbc1d20Q9D9I4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbc1d20Q9D9I4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbc1d20Q9D9I4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbc1d20Q9D9I4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbc1d20Q9D9I4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbc1d20Q9D9I4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbc1d20Q9D9I4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbc1d20Q9D9I4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbc1d20Q9D9I4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tbc1d20Q9D9I4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tbc1d20Q9D9I4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tbc1d20Q9D9I4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tbc1d20Q9D9I4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tbc1d20Q9D9I4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tbc1d20Q9D9I4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tbc1d20Q9D9I4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tbc1d20Q9D9I4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tbc1d20Q9D9I4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tbc1d20Q9D9I4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tbc1d20Q9D9I4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tbc1d20Q9D9I4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tbc1d20Q9D9I4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tbc1d20Q9D9I4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tbc1d20Q9D9I4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tbc1d20Q9D9I4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tbc1d20Q9D9I4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tbc1d20Q9D9I4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tbc1d20Q9D9I4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tbc1d20Q9D9I4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tbc1d20Q9D9I4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tbc1d20Q9D9I4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tbc1d20Q9D9I4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tbc1d20Q9D9I4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tbc1d20Q9D9I4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tbc1d20Q9D9I4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tbc1d20Q9D9I4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tbc1d20Q9D9I4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tbc1d20Q9D9I4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tbc1d20Q9D9I4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tbc1d20Q9D9I4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tbc1d20Q9D9I4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tbc1d20Q9D9I4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tbc1d20Q9D9I4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tbc1d20Q9D9I4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tbc1d20Q9D9I4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tbc1d20Q9D9I4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tbc1d20Q9D9I4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tbc1d20Q9D9I4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tbc1d20Q9D9I4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tbc1d20Q9D9I4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tbc1d20Q9D9I4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tbc1d20Q9D9I4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tbc1d20Q9D9I4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tbc1d20Q9D9I4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tbc1d20Q9D9I4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tbc1d20Q9D9I4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tbc1d20Q9D9I4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tbc1d20Q9D9I4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tbc1d20Q9D9I4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tbc1d20Q9D9I4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tbc1d20Q9D9I4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tbc1d20Q9D9I4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tbc1d20Q9D9I4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tbc1d20Q9D9I4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tbc1d20Q9D9I4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tbc1d20Q9D9I4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tbc1d20Q9D9I4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tbc1d20Q9D9I4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tbc1d20Q9D9I4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tbc1d20Q9D9I4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms