Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg7Q9D906 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg7Q9D906 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg7Q9D906 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg7Q9D906 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg7Q9D906 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg7Q9D906 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg7Q9D906 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg7Q9D906 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg7Q9D906 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg7Q9D906 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg7Q9D906 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg7Q9D906 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg7Q9D906 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg7Q9D906 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg7Q9D906 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg7Q9D906 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg7Q9D906 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg7Q9D906 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg7Q9D906 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg7Q9D906 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg7Q9D906 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg7Q9D906 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg7Q9D906 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg7Q9D906 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg7Q9D906 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg7Q9D906 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg7Q9D906 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg7Q9D906 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg7Q9D906 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg7Q9D906 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg7Q9D906 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg7Q9D906 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg7Q9D906 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg7Q9D906 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg7Q9D906 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atg7Q9D906 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg7Q9D906 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg7Q9D906 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg7Q9D906 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg7Q9D906 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg7Q9D906 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg7Q9D906 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg7Q9D906 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg7Q9D906 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg7Q9D906 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg7Q9D906 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg7Q9D906 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg7Q9D906 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg7Q9D906 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg7Q9D906 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg7Q9D906 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg7Q9D906 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg7Q9D906 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg7Q9D906 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg7Q9D906 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg7Q9D906 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg7Q9D906 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg7Q9D906 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg7Q9D906 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg7Q9D906 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg7Q9D906 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg7Q9D906 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg7Q9D906 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg7Q9D906 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg7Q9D906 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg7Q9D906 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg7Q9D906 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg7Q9D906 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg7Q9D906 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg7Q9D906 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg7Q9D906 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg7Q9D906 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg7Q9D906 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg7Q9D906 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg7Q9D906 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg7Q9D906 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg7Q9D906 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg7Q9D906 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg7Q9D906 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg7Q9D906 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg7Q9D906 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg7Q9D906 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg7Q9D906 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg7Q9D906 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg7Q9D906 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg7Q9D906 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg7Q9D906 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg7Q9D906 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg7Q9D906 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg7Q9D906 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg7Q9D906 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg7Q9D906 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg7Q9D906 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg7Q9D906 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg7Q9D906 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg7Q9D906 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg7Q9D906 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg7Q9D906 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg7Q9D906 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.2 ms