Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8V7

Sec11c, Signal peptidase complex catalytic subunit SEC11C, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec11cQ9D8V7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sec11cQ9D8V7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sec11cQ9D8V7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sec11cQ9D8V7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sec11cQ9D8V7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sec11cQ9D8V7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sec11cQ9D8V7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sec11cQ9D8V7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sec11cQ9D8V7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sec11cQ9D8V7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sec11cQ9D8V7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sec11cQ9D8V7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sec11cQ9D8V7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sec11cQ9D8V7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sec11cQ9D8V7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sec11cQ9D8V7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sec11cQ9D8V7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sec11cQ9D8V7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sec11cQ9D8V7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sec11cQ9D8V7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sec11cQ9D8V7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sec11cQ9D8V7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sec11cQ9D8V7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sec11cQ9D8V7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sec11cQ9D8V7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sec11cQ9D8V7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sec11cQ9D8V7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sec11cQ9D8V7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sec11cQ9D8V7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sec11cQ9D8V7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sec11cQ9D8V7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sec11cQ9D8V7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sec11cQ9D8V7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sec11cQ9D8V7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sec11cQ9D8V7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sec11cQ9D8V7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sec11cQ9D8V7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sec11cQ9D8V7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sec11cQ9D8V7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sec11cQ9D8V7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sec11cQ9D8V7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sec11cQ9D8V7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sec11cQ9D8V7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sec11cQ9D8V7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sec11cQ9D8V7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sec11cQ9D8V7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sec11cQ9D8V7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sec11cQ9D8V7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sec11cQ9D8V7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sec11cQ9D8V7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sec11cQ9D8V7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sec11cQ9D8V7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sec11cQ9D8V7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sec11cQ9D8V7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sec11cQ9D8V7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sec11cQ9D8V7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sec11cQ9D8V7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sec11cQ9D8V7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sec11cQ9D8V7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sec11cQ9D8V7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sec11cQ9D8V7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sec11cQ9D8V7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sec11cQ9D8V7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sec11cQ9D8V7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sec11cQ9D8V7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sec11cQ9D8V7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sec11cQ9D8V7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sec11cQ9D8V7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sec11cQ9D8V7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sec11cQ9D8V7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sec11cQ9D8V7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sec11cQ9D8V7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sec11cQ9D8V7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sec11cQ9D8V7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sec11cQ9D8V7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sec11cQ9D8V7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sec11cQ9D8V7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sec11cQ9D8V7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec11cQ9D8V7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec11cQ9D8V7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec11cQ9D8V7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec11cQ9D8V7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec11cQ9D8V7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sec11cQ9D8V7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sec11cQ9D8V7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sec11cQ9D8V7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sec11cQ9D8V7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sec11cQ9D8V7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sec11cQ9D8V7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sec11cQ9D8V7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sec11cQ9D8V7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sec11cQ9D8V7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec11cQ9D8V7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec11cQ9D8V7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec11cQ9D8V7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec11cQ9D8V7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec11cQ9D8V7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec11cQ9D8V7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec11cQ9D8V7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec11cQ9D8V7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms