Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
U2af1Q9D883 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
U2af1Q9D883 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
U2af1Q9D883 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
U2af1Q9D883 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
U2af1Q9D883 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
U2af1Q9D883 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
U2af1Q9D883 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
U2af1Q9D883 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
U2af1Q9D883 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
U2af1Q9D883 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
U2af1Q9D883 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
U2af1Q9D883 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
U2af1Q9D883 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
U2af1Q9D883 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
U2af1Q9D883 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
U2af1Q9D883 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
U2af1Q9D883 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
U2af1Q9D883 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
U2af1Q9D883 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
U2af1Q9D883 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
U2af1Q9D883 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
U2af1Q9D883 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
U2af1Q9D883 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
U2af1Q9D883 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
U2af1Q9D883 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
U2af1Q9D883 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
U2af1Q9D883 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
U2af1Q9D883 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
U2af1Q9D883 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
U2af1Q9D883 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
U2af1Q9D883 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
U2af1Q9D883 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
U2af1Q9D883 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
U2af1Q9D883 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
U2af1Q9D883 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
U2af1Q9D883 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
U2af1Q9D883 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
U2af1Q9D883 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
U2af1Q9D883 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
U2af1Q9D883 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
U2af1Q9D883 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
U2af1Q9D883 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
U2af1Q9D883 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
U2af1Q9D883 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
U2af1Q9D883 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
U2af1Q9D883 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
U2af1Q9D883 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
U2af1Q9D883 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
U2af1Q9D883 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
U2af1Q9D883 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
U2af1Q9D883 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
U2af1Q9D883 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
U2af1Q9D883 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
U2af1Q9D883 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
U2af1Q9D883 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
U2af1Q9D883 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
U2af1Q9D883 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
U2af1Q9D883 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
U2af1Q9D883 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
U2af1Q9D883 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
U2af1Q9D883 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
U2af1Q9D883 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
U2af1Q9D883 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
U2af1Q9D883 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
U2af1Q9D883 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
U2af1Q9D883 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
U2af1Q9D883 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
U2af1Q9D883 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
U2af1Q9D883 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
U2af1Q9D883 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
U2af1Q9D883 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
U2af1Q9D883 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
U2af1Q9D883 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
U2af1Q9D883 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
U2af1Q9D883 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
U2af1Q9D883 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
U2af1Q9D883 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
U2af1Q9D883 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
U2af1Q9D883 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
U2af1Q9D883 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
U2af1Q9D883 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
U2af1Q9D883 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
U2af1Q9D883 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
U2af1Q9D883 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
U2af1Q9D883 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
U2af1Q9D883 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
U2af1Q9D883 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
U2af1Q9D883 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
U2af1Q9D883 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
U2af1Q9D883 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
U2af1Q9D883 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
U2af1Q9D883 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
U2af1Q9D883 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
U2af1Q9D883 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
U2af1Q9D883 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
U2af1Q9D883 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
U2af1Q9D883 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
U2af1Q9D883 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
U2af1Q9D883 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms