Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Capns2Q9D7J7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Capns2Q9D7J7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Capns2Q9D7J7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Capns2Q9D7J7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capns2Q9D7J7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capns2Q9D7J7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Capns2Q9D7J7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Capns2Q9D7J7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Capns2Q9D7J7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Capns2Q9D7J7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Capns2Q9D7J7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capns2Q9D7J7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capns2Q9D7J7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capns2Q9D7J7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Capns2Q9D7J7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Capns2Q9D7J7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Capns2Q9D7J7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capns2Q9D7J7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capns2Q9D7J7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capns2Q9D7J7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capns2Q9D7J7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Capns2Q9D7J7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Capns2Q9D7J7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Capns2Q9D7J7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Capns2Q9D7J7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Capns2Q9D7J7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Capns2Q9D7J7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Capns2Q9D7J7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Capns2Q9D7J7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Capns2Q9D7J7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Capns2Q9D7J7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Capns2Q9D7J7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Capns2Q9D7J7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Capns2Q9D7J7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Capns2Q9D7J7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Capns2Q9D7J7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Capns2Q9D7J7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Capns2Q9D7J7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Capns2Q9D7J7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Capns2Q9D7J7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Capns2Q9D7J7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Capns2Q9D7J7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Capns2Q9D7J7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Capns2Q9D7J7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Capns2Q9D7J7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Capns2Q9D7J7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Capns2Q9D7J7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Capns2Q9D7J7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Capns2Q9D7J7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Capns2Q9D7J7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Capns2Q9D7J7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Capns2Q9D7J7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Capns2Q9D7J7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Capns2Q9D7J7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Capns2Q9D7J7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Capns2Q9D7J7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Capns2Q9D7J7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Capns2Q9D7J7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Capns2Q9D7J7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Capns2Q9D7J7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Capns2Q9D7J7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Capns2Q9D7J7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Capns2Q9D7J7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Capns2Q9D7J7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Capns2Q9D7J7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Capns2Q9D7J7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Capns2Q9D7J7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Capns2Q9D7J7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Capns2Q9D7J7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Capns2Q9D7J7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Capns2Q9D7J7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capns2Q9D7J7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capns2Q9D7J7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capns2Q9D7J7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capns2Q9D7J7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capns2Q9D7J7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capns2Q9D7J7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capns2Q9D7J7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Capns2Q9D7J7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capns2Q9D7J7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capns2Q9D7J7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capns2Q9D7J7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capns2Q9D7J7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capns2Q9D7J7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capns2Q9D7J7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capns2Q9D7J7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capns2Q9D7J7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capns2Q9D7J7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capns2Q9D7J7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capns2Q9D7J7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capns2Q9D7J7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capns2Q9D7J7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capns2Q9D7J7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capns2Q9D7J7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capns2Q9D7J7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capns2Q9D7J7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Capns2Q9D7J7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capns2Q9D7J7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Capns2Q9D7J7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms