Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sf3a3Q9D554 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sf3a3Q9D554 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sf3a3Q9D554 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sf3a3Q9D554 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sf3a3Q9D554 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sf3a3Q9D554 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sf3a3Q9D554 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sf3a3Q9D554 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sf3a3Q9D554 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sf3a3Q9D554 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sf3a3Q9D554 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sf3a3Q9D554 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sf3a3Q9D554 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sf3a3Q9D554 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sf3a3Q9D554 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sf3a3Q9D554 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sf3a3Q9D554 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3a3Q9D554 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3a3Q9D554 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3a3Q9D554 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sf3a3Q9D554 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sf3a3Q9D554 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sf3a3Q9D554 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3a3Q9D554 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3a3Q9D554 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3a3Q9D554 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3a3Q9D554 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3a3Q9D554 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sf3a3Q9D554 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sf3a3Q9D554 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sf3a3Q9D554 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sf3a3Q9D554 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sf3a3Q9D554 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sf3a3Q9D554 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sf3a3Q9D554 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sf3a3Q9D554 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sf3a3Q9D554 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sf3a3Q9D554 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sf3a3Q9D554 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sf3a3Q9D554 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sf3a3Q9D554 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sf3a3Q9D554 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sf3a3Q9D554 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sf3a3Q9D554 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sf3a3Q9D554 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sf3a3Q9D554 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sf3a3Q9D554 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sf3a3Q9D554 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sf3a3Q9D554 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sf3a3Q9D554 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3a3Q9D554 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3a3Q9D554 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3a3Q9D554 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3a3Q9D554 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3a3Q9D554 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3a3Q9D554 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3a3Q9D554 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3a3Q9D554 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3a3Q9D554 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3a3Q9D554 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3a3Q9D554 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3a3Q9D554 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3a3Q9D554 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3a3Q9D554 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3a3Q9D554 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sf3a3Q9D554 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sf3a3Q9D554 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sf3a3Q9D554 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sf3a3Q9D554 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sf3a3Q9D554 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3a3Q9D554 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3a3Q9D554 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3a3Q9D554 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sf3a3Q9D554 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sf3a3Q9D554 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sf3a3Q9D554 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sf3a3Q9D554 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sf3a3Q9D554 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sf3a3Q9D554 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sf3a3Q9D554 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sf3a3Q9D554 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sf3a3Q9D554 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sf3a3Q9D554 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sf3a3Q9D554 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sf3a3Q9D554 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sf3a3Q9D554 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sf3a3Q9D554 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sf3a3Q9D554 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3a3Q9D554 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3a3Q9D554 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3a3Q9D554 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3a3Q9D554 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3a3Q9D554 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3a3Q9D554 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3a3Q9D554 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sf3a3Q9D554 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sf3a3Q9D554 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3a3Q9D554 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3a3Q9D554 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms