Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3404Q9D506 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3404Q9D506 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3404Q9D506 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3404Q9D506 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3404Q9D506 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3404Q9D506 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3404Q9D506 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3404Q9D506 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3404Q9D506 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3404Q9D506 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3404Q9D506 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3404Q9D506 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3404Q9D506 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3404Q9D506 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3404Q9D506 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3404Q9D506 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3404Q9D506 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3404Q9D506 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3404Q9D506 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3404Q9D506 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3404Q9D506 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3404Q9D506 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3404Q9D506 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3404Q9D506 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3404Q9D506 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3404Q9D506 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3404Q9D506 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3404Q9D506 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3404Q9D506 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3404Q9D506 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3404Q9D506 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3404Q9D506 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3404Q9D506 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3404Q9D506 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3404Q9D506 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3404Q9D506 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3404Q9D506 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3404Q9D506 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3404Q9D506 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3404Q9D506 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3404Q9D506 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3404Q9D506 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3404Q9D506 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3404Q9D506 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3404Q9D506 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3404Q9D506 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3404Q9D506 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3404Q9D506 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3404Q9D506 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3404Q9D506 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3404Q9D506 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3404Q9D506 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3404Q9D506 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3404Q9D506 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3404Q9D506 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3404Q9D506 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3404Q9D506 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm3404Q9D506 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm3404Q9D506 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm3404Q9D506 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm3404Q9D506 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm3404Q9D506 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm3404Q9D506 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm3404Q9D506 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3404Q9D506 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3404Q9D506 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3404Q9D506 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3404Q9D506 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3404Q9D506 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3404Q9D506 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3404Q9D506 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3404Q9D506 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3404Q9D506 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3404Q9D506 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3404Q9D506 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3404Q9D506 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3404Q9D506 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3404Q9D506 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3404Q9D506 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3404Q9D506 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3404Q9D506 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3404Q9D506 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3404Q9D506 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3404Q9D506 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3404Q9D506 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3404Q9D506 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3404Q9D506 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3404Q9D506 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3404Q9D506 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3404Q9D506 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3404Q9D506 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3404Q9D506 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3404Q9D506 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm3404Q9D506 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm3404Q9D506 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm3404Q9D506 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm3404Q9D506 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm3404Q9D506 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm3404Q9D506 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 177.2 ms