Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pabpc6Q9D4E6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pabpc6Q9D4E6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pabpc6Q9D4E6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pabpc6Q9D4E6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pabpc6Q9D4E6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pabpc6Q9D4E6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pabpc6Q9D4E6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pabpc6Q9D4E6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pabpc6Q9D4E6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pabpc6Q9D4E6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pabpc6Q9D4E6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pabpc6Q9D4E6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pabpc6Q9D4E6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pabpc6Q9D4E6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pabpc6Q9D4E6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pabpc6Q9D4E6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pabpc6Q9D4E6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pabpc6Q9D4E6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pabpc6Q9D4E6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Pabpc6Q9D4E6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pabpc6Q9D4E6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pabpc6Q9D4E6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Pabpc6Q9D4E6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pabpc6Q9D4E6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pabpc6Q9D4E6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pabpc6Q9D4E6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pabpc6Q9D4E6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pabpc6Q9D4E6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pabpc6Q9D4E6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pabpc6Q9D4E6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pabpc6Q9D4E6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pabpc6Q9D4E6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pabpc6Q9D4E6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pabpc6Q9D4E6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pabpc6Q9D4E6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pabpc6Q9D4E6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pabpc6Q9D4E6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pabpc6Q9D4E6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pabpc6Q9D4E6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pabpc6Q9D4E6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pabpc6Q9D4E6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pabpc6Q9D4E6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pabpc6Q9D4E6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Pabpc6Q9D4E6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pabpc6Q9D4E6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pabpc6Q9D4E6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pabpc6Q9D4E6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pabpc6Q9D4E6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pabpc6Q9D4E6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pabpc6Q9D4E6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pabpc6Q9D4E6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pabpc6Q9D4E6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Pabpc6Q9D4E6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pabpc6Q9D4E6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pabpc6Q9D4E6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pabpc6Q9D4E6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pabpc6Q9D4E6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pabpc6Q9D4E6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pabpc6Q9D4E6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pabpc6Q9D4E6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pabpc6Q9D4E6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pabpc6Q9D4E6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pabpc6Q9D4E6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pabpc6Q9D4E6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pabpc6Q9D4E6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pabpc6Q9D4E6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pabpc6Q9D4E6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pabpc6Q9D4E6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pabpc6Q9D4E6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Pabpc6Q9D4E6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pabpc6Q9D4E6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pabpc6Q9D4E6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pabpc6Q9D4E6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pabpc6Q9D4E6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pabpc6Q9D4E6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pabpc6Q9D4E6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pabpc6Q9D4E6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pabpc6Q9D4E6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pabpc6Q9D4E6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pabpc6Q9D4E6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pabpc6Q9D4E6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pabpc6Q9D4E6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pabpc6Q9D4E6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pabpc6Q9D4E6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pabpc6Q9D4E6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pabpc6Q9D4E6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pabpc6Q9D4E6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pabpc6Q9D4E6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pabpc6Q9D4E6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pabpc6Q9D4E6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pabpc6Q9D4E6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pabpc6Q9D4E6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pabpc6Q9D4E6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pabpc6Q9D4E6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Pabpc6Q9D4E6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pabpc6Q9D4E6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pabpc6Q9D4E6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pabpc6Q9D4E6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pabpc6Q9D4E6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms