Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clvs1Q9D4C9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clvs1Q9D4C9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clvs1Q9D4C9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clvs1Q9D4C9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clvs1Q9D4C9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clvs1Q9D4C9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clvs1Q9D4C9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clvs1Q9D4C9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clvs1Q9D4C9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clvs1Q9D4C9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clvs1Q9D4C9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clvs1Q9D4C9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clvs1Q9D4C9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clvs1Q9D4C9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clvs1Q9D4C9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clvs1Q9D4C9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clvs1Q9D4C9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clvs1Q9D4C9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Clvs1Q9D4C9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clvs1Q9D4C9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Clvs1Q9D4C9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clvs1Q9D4C9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Clvs1Q9D4C9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clvs1Q9D4C9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clvs1Q9D4C9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clvs1Q9D4C9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clvs1Q9D4C9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clvs1Q9D4C9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Clvs1Q9D4C9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clvs1Q9D4C9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clvs1Q9D4C9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clvs1Q9D4C9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clvs1Q9D4C9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clvs1Q9D4C9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clvs1Q9D4C9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clvs1Q9D4C9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clvs1Q9D4C9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clvs1Q9D4C9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clvs1Q9D4C9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clvs1Q9D4C9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clvs1Q9D4C9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clvs1Q9D4C9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clvs1Q9D4C9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clvs1Q9D4C9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clvs1Q9D4C9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clvs1Q9D4C9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clvs1Q9D4C9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clvs1Q9D4C9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clvs1Q9D4C9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clvs1Q9D4C9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clvs1Q9D4C9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clvs1Q9D4C9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clvs1Q9D4C9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clvs1Q9D4C9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Clvs1Q9D4C9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clvs1Q9D4C9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clvs1Q9D4C9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clvs1Q9D4C9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clvs1Q9D4C9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clvs1Q9D4C9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clvs1Q9D4C9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clvs1Q9D4C9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clvs1Q9D4C9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clvs1Q9D4C9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clvs1Q9D4C9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clvs1Q9D4C9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clvs1Q9D4C9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clvs1Q9D4C9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Clvs1Q9D4C9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clvs1Q9D4C9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clvs1Q9D4C9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clvs1Q9D4C9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clvs1Q9D4C9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clvs1Q9D4C9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clvs1Q9D4C9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clvs1Q9D4C9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clvs1Q9D4C9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clvs1Q9D4C9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clvs1Q9D4C9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clvs1Q9D4C9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clvs1Q9D4C9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clvs1Q9D4C9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Clvs1Q9D4C9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clvs1Q9D4C9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clvs1Q9D4C9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clvs1Q9D4C9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clvs1Q9D4C9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clvs1Q9D4C9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clvs1Q9D4C9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clvs1Q9D4C9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Clvs1Q9D4C9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Clvs1Q9D4C9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clvs1Q9D4C9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Clvs1Q9D4C9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Clvs1Q9D4C9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms