Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3T1

4933436I01Rik, RIKEN cDNA 4933436I01, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933436I01RikQ9D3T1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4933436I01RikQ9D3T1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
4933436I01RikQ9D3T1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
4933436I01RikQ9D3T1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4933436I01RikQ9D3T1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4933436I01RikQ9D3T1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
4933436I01RikQ9D3T1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933436I01RikQ9D3T1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933436I01RikQ9D3T1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4933436I01RikQ9D3T1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4933436I01RikQ9D3T1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4933436I01RikQ9D3T1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4933436I01RikQ9D3T1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
4933436I01RikQ9D3T1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4933436I01RikQ9D3T1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4933436I01RikQ9D3T1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4933436I01RikQ9D3T1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4933436I01RikQ9D3T1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933436I01RikQ9D3T1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933436I01RikQ9D3T1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933436I01RikQ9D3T1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933436I01RikQ9D3T1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933436I01RikQ9D3T1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933436I01RikQ9D3T1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933436I01RikQ9D3T1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4933436I01RikQ9D3T1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4933436I01RikQ9D3T1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4933436I01RikQ9D3T1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933436I01RikQ9D3T1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933436I01RikQ9D3T1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933436I01RikQ9D3T1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933436I01RikQ9D3T1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933436I01RikQ9D3T1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933436I01RikQ9D3T1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933436I01RikQ9D3T1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933436I01RikQ9D3T1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4933436I01RikQ9D3T1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
4933436I01RikQ9D3T1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4933436I01RikQ9D3T1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
4933436I01RikQ9D3T1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933436I01RikQ9D3T1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933436I01RikQ9D3T1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933436I01RikQ9D3T1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933436I01RikQ9D3T1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933436I01RikQ9D3T1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933436I01RikQ9D3T1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933436I01RikQ9D3T1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
4933436I01RikQ9D3T1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933436I01RikQ9D3T1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933436I01RikQ9D3T1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933436I01RikQ9D3T1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933436I01RikQ9D3T1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933436I01RikQ9D3T1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933436I01RikQ9D3T1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933436I01RikQ9D3T1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933436I01RikQ9D3T1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933436I01RikQ9D3T1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933436I01RikQ9D3T1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933436I01RikQ9D3T1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933436I01RikQ9D3T1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933436I01RikQ9D3T1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933436I01RikQ9D3T1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933436I01RikQ9D3T1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933436I01RikQ9D3T1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933436I01RikQ9D3T1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933436I01RikQ9D3T1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933436I01RikQ9D3T1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933436I01RikQ9D3T1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933436I01RikQ9D3T1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933436I01RikQ9D3T1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933436I01RikQ9D3T1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933436I01RikQ9D3T1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933436I01RikQ9D3T1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933436I01RikQ9D3T1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
4933436I01RikQ9D3T1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933436I01RikQ9D3T1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933436I01RikQ9D3T1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933436I01RikQ9D3T1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933436I01RikQ9D3T1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933436I01RikQ9D3T1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933436I01RikQ9D3T1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933436I01RikQ9D3T1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933436I01RikQ9D3T1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933436I01RikQ9D3T1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933436I01RikQ9D3T1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933436I01RikQ9D3T1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933436I01RikQ9D3T1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933436I01RikQ9D3T1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
4933436I01RikQ9D3T1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933436I01RikQ9D3T1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933436I01RikQ9D3T1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933436I01RikQ9D3T1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933436I01RikQ9D3T1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933436I01RikQ9D3T1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933436I01RikQ9D3T1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933436I01RikQ9D3T1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933436I01RikQ9D3T1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933436I01RikQ9D3T1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933436I01RikQ9D3T1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933436I01RikQ9D3T1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms