Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt20Q9D312 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt20Q9D312 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt20Q9D312 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Krt20Q9D312 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Krt20Q9D312 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt20Q9D312 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt20Q9D312 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt20Q9D312 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt20Q9D312 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt20Q9D312 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt20Q9D312 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt20Q9D312 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt20Q9D312 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt20Q9D312 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt20Q9D312 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt20Q9D312 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt20Q9D312 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt20Q9D312 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt20Q9D312 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt20Q9D312 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt20Q9D312 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt20Q9D312 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt20Q9D312 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt20Q9D312 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt20Q9D312 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt20Q9D312 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt20Q9D312 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt20Q9D312 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt20Q9D312 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt20Q9D312 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt20Q9D312 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt20Q9D312 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt20Q9D312 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt20Q9D312 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt20Q9D312 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt20Q9D312 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt20Q9D312 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt20Q9D312 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt20Q9D312 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt20Q9D312 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Krt20Q9D312 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Krt20Q9D312 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Krt20Q9D312 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Krt20Q9D312 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt20Q9D312 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt20Q9D312 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt20Q9D312 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt20Q9D312 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt20Q9D312 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt20Q9D312 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt20Q9D312 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt20Q9D312 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt20Q9D312 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt20Q9D312 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt20Q9D312 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt20Q9D312 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt20Q9D312 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt20Q9D312 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt20Q9D312 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt20Q9D312 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt20Q9D312 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt20Q9D312 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt20Q9D312 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt20Q9D312 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt20Q9D312 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt20Q9D312 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt20Q9D312 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt20Q9D312 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt20Q9D312 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt20Q9D312 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt20Q9D312 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt20Q9D312 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt20Q9D312 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt20Q9D312 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt20Q9D312 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt20Q9D312 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt20Q9D312 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt20Q9D312 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt20Q9D312 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt20Q9D312 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt20Q9D312 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt20Q9D312 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt20Q9D312 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt20Q9D312 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt20Q9D312 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt20Q9D312 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt20Q9D312 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt20Q9D312 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt20Q9D312 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt20Q9D312 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt20Q9D312 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt20Q9D312 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt20Q9D312 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt20Q9D312 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt20Q9D312 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt20Q9D312 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt20Q9D312 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt20Q9D312 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt20Q9D312 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms