Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2N9

Vps33a, Vacuolar protein sorting-associated protein 33A, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33aQ9D2N9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps33aQ9D2N9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps33aQ9D2N9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps33aQ9D2N9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps33aQ9D2N9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps33aQ9D2N9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps33aQ9D2N9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps33aQ9D2N9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps33aQ9D2N9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps33aQ9D2N9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps33aQ9D2N9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps33aQ9D2N9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps33aQ9D2N9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps33aQ9D2N9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps33aQ9D2N9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps33aQ9D2N9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps33aQ9D2N9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps33aQ9D2N9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps33aQ9D2N9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps33aQ9D2N9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps33aQ9D2N9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vps33aQ9D2N9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps33aQ9D2N9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps33aQ9D2N9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps33aQ9D2N9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps33aQ9D2N9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps33aQ9D2N9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps33aQ9D2N9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps33aQ9D2N9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps33aQ9D2N9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps33aQ9D2N9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps33aQ9D2N9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps33aQ9D2N9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps33aQ9D2N9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps33aQ9D2N9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps33aQ9D2N9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps33aQ9D2N9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps33aQ9D2N9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps33aQ9D2N9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps33aQ9D2N9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps33aQ9D2N9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps33aQ9D2N9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps33aQ9D2N9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps33aQ9D2N9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps33aQ9D2N9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps33aQ9D2N9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps33aQ9D2N9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps33aQ9D2N9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps33aQ9D2N9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps33aQ9D2N9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps33aQ9D2N9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps33aQ9D2N9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps33aQ9D2N9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps33aQ9D2N9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps33aQ9D2N9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps33aQ9D2N9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps33aQ9D2N9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps33aQ9D2N9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps33aQ9D2N9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps33aQ9D2N9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps33aQ9D2N9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps33aQ9D2N9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps33aQ9D2N9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps33aQ9D2N9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps33aQ9D2N9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps33aQ9D2N9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps33aQ9D2N9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps33aQ9D2N9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps33aQ9D2N9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps33aQ9D2N9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps33aQ9D2N9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps33aQ9D2N9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps33aQ9D2N9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps33aQ9D2N9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps33aQ9D2N9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps33aQ9D2N9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps33aQ9D2N9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps33aQ9D2N9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps33aQ9D2N9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps33aQ9D2N9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps33aQ9D2N9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps33aQ9D2N9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps33aQ9D2N9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps33aQ9D2N9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps33aQ9D2N9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps33aQ9D2N9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps33aQ9D2N9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps33aQ9D2N9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps33aQ9D2N9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps33aQ9D2N9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps33aQ9D2N9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps33aQ9D2N9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps33aQ9D2N9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps33aQ9D2N9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps33aQ9D2N9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps33aQ9D2N9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps33aQ9D2N9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps33aQ9D2N9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps33aQ9D2N9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps33aQ9D2N9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms