Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D6

Cthrc1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cthrc1Q9D1D6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cthrc1Q9D1D6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cthrc1Q9D1D6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cthrc1Q9D1D6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cthrc1Q9D1D6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cthrc1Q9D1D6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cthrc1Q9D1D6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cthrc1Q9D1D6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cthrc1Q9D1D6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cthrc1Q9D1D6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cthrc1Q9D1D6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cthrc1Q9D1D6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cthrc1Q9D1D6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cthrc1Q9D1D6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cthrc1Q9D1D6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cthrc1Q9D1D6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cthrc1Q9D1D6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cthrc1Q9D1D6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cthrc1Q9D1D6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cthrc1Q9D1D6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cthrc1Q9D1D6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cthrc1Q9D1D6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cthrc1Q9D1D6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cthrc1Q9D1D6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cthrc1Q9D1D6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cthrc1Q9D1D6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cthrc1Q9D1D6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cthrc1Q9D1D6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cthrc1Q9D1D6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cthrc1Q9D1D6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cthrc1Q9D1D6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cthrc1Q9D1D6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cthrc1Q9D1D6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cthrc1Q9D1D6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cthrc1Q9D1D6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cthrc1Q9D1D6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cthrc1Q9D1D6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cthrc1Q9D1D6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cthrc1Q9D1D6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cthrc1Q9D1D6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cthrc1Q9D1D6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cthrc1Q9D1D6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cthrc1Q9D1D6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cthrc1Q9D1D6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cthrc1Q9D1D6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cthrc1Q9D1D6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cthrc1Q9D1D6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cthrc1Q9D1D6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cthrc1Q9D1D6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cthrc1Q9D1D6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cthrc1Q9D1D6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cthrc1Q9D1D6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cthrc1Q9D1D6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cthrc1Q9D1D6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cthrc1Q9D1D6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cthrc1Q9D1D6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cthrc1Q9D1D6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cthrc1Q9D1D6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cthrc1Q9D1D6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cthrc1Q9D1D6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cthrc1Q9D1D6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cthrc1Q9D1D6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cthrc1Q9D1D6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cthrc1Q9D1D6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cthrc1Q9D1D6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cthrc1Q9D1D6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cthrc1Q9D1D6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cthrc1Q9D1D6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cthrc1Q9D1D6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cthrc1Q9D1D6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cthrc1Q9D1D6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cthrc1Q9D1D6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cthrc1Q9D1D6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cthrc1Q9D1D6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cthrc1Q9D1D6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cthrc1Q9D1D6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cthrc1Q9D1D6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cthrc1Q9D1D6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cthrc1Q9D1D6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cthrc1Q9D1D6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cthrc1Q9D1D6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cthrc1Q9D1D6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cthrc1Q9D1D6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cthrc1Q9D1D6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cthrc1Q9D1D6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cthrc1Q9D1D6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cthrc1Q9D1D6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cthrc1Q9D1D6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cthrc1Q9D1D6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cthrc1Q9D1D6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cthrc1Q9D1D6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cthrc1Q9D1D6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cthrc1Q9D1D6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cthrc1Q9D1D6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cthrc1Q9D1D6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cthrc1Q9D1D6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cthrc1Q9D1D6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cthrc1Q9D1D6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cthrc1Q9D1D6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cthrc1Q9D1D6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms