Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mrpl28Q9D1B9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mrpl28Q9D1B9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mrpl28Q9D1B9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mrpl28Q9D1B9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mrpl28Q9D1B9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mrpl28Q9D1B9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mrpl28Q9D1B9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Mrpl28Q9D1B9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mrpl28Q9D1B9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mrpl28Q9D1B9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms