Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab3bQ9CZT8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab3bQ9CZT8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab3bQ9CZT8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab3bQ9CZT8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab3bQ9CZT8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab3bQ9CZT8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab3bQ9CZT8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab3bQ9CZT8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab3bQ9CZT8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab3bQ9CZT8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab3bQ9CZT8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab3bQ9CZT8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab3bQ9CZT8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab3bQ9CZT8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab3bQ9CZT8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab3bQ9CZT8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab3bQ9CZT8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab3bQ9CZT8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab3bQ9CZT8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab3bQ9CZT8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab3bQ9CZT8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab3bQ9CZT8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab3bQ9CZT8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab3bQ9CZT8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab3bQ9CZT8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab3bQ9CZT8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab3bQ9CZT8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab3bQ9CZT8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab3bQ9CZT8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab3bQ9CZT8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab3bQ9CZT8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab3bQ9CZT8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab3bQ9CZT8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab3bQ9CZT8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab3bQ9CZT8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rab3bQ9CZT8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Rab3bQ9CZT8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab3bQ9CZT8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab3bQ9CZT8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab3bQ9CZT8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab3bQ9CZT8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab3bQ9CZT8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab3bQ9CZT8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab3bQ9CZT8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab3bQ9CZT8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab3bQ9CZT8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab3bQ9CZT8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab3bQ9CZT8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab3bQ9CZT8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab3bQ9CZT8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab3bQ9CZT8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab3bQ9CZT8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab3bQ9CZT8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab3bQ9CZT8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab3bQ9CZT8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab3bQ9CZT8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab3bQ9CZT8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab3bQ9CZT8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab3bQ9CZT8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab3bQ9CZT8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab3bQ9CZT8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab3bQ9CZT8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab3bQ9CZT8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab3bQ9CZT8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab3bQ9CZT8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab3bQ9CZT8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab3bQ9CZT8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab3bQ9CZT8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab3bQ9CZT8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab3bQ9CZT8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab3bQ9CZT8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab3bQ9CZT8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab3bQ9CZT8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab3bQ9CZT8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab3bQ9CZT8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab3bQ9CZT8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab3bQ9CZT8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab3bQ9CZT8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab3bQ9CZT8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab3bQ9CZT8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab3bQ9CZT8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab3bQ9CZT8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab3bQ9CZT8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab3bQ9CZT8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab3bQ9CZT8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab3bQ9CZT8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab3bQ9CZT8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab3bQ9CZT8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab3bQ9CZT8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab3bQ9CZT8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab3bQ9CZT8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab3bQ9CZT8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab3bQ9CZT8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab3bQ9CZT8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab3bQ9CZT8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab3bQ9CZT8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab3bQ9CZT8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab3bQ9CZT8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab3bQ9CZT8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101 ms