Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWH6

Psma8, Proteasome subunit alpha type-7-like, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma8Q9CWH6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psma8Q9CWH6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psma8Q9CWH6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psma8Q9CWH6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psma8Q9CWH6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psma8Q9CWH6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psma8Q9CWH6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psma8Q9CWH6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psma8Q9CWH6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psma8Q9CWH6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psma8Q9CWH6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psma8Q9CWH6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psma8Q9CWH6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psma8Q9CWH6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psma8Q9CWH6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psma8Q9CWH6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psma8Q9CWH6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Psma8Q9CWH6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Psma8Q9CWH6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psma8Q9CWH6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psma8Q9CWH6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psma8Q9CWH6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psma8Q9CWH6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psma8Q9CWH6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psma8Q9CWH6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psma8Q9CWH6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psma8Q9CWH6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psma8Q9CWH6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psma8Q9CWH6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psma8Q9CWH6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psma8Q9CWH6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psma8Q9CWH6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psma8Q9CWH6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psma8Q9CWH6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psma8Q9CWH6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psma8Q9CWH6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psma8Q9CWH6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psma8Q9CWH6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Psma8Q9CWH6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psma8Q9CWH6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psma8Q9CWH6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Psma8Q9CWH6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psma8Q9CWH6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psma8Q9CWH6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psma8Q9CWH6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psma8Q9CWH6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psma8Q9CWH6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psma8Q9CWH6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psma8Q9CWH6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psma8Q9CWH6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psma8Q9CWH6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psma8Q9CWH6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psma8Q9CWH6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psma8Q9CWH6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psma8Q9CWH6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psma8Q9CWH6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psma8Q9CWH6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psma8Q9CWH6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psma8Q9CWH6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psma8Q9CWH6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psma8Q9CWH6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psma8Q9CWH6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psma8Q9CWH6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psma8Q9CWH6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psma8Q9CWH6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psma8Q9CWH6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psma8Q9CWH6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psma8Q9CWH6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psma8Q9CWH6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psma8Q9CWH6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psma8Q9CWH6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Psma8Q9CWH6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psma8Q9CWH6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psma8Q9CWH6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psma8Q9CWH6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Psma8Q9CWH6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psma8Q9CWH6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psma8Q9CWH6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psma8Q9CWH6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psma8Q9CWH6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psma8Q9CWH6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Psma8Q9CWH6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psma8Q9CWH6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psma8Q9CWH6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psma8Q9CWH6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psma8Q9CWH6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Psma8Q9CWH6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psma8Q9CWH6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psma8Q9CWH6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psma8Q9CWH6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psma8Q9CWH6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psma8Q9CWH6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psma8Q9CWH6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psma8Q9CWH6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psma8Q9CWH6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psma8Q9CWH6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psma8Q9CWH6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psma8Q9CWH6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psma8Q9CWH6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psma8Q9CWH6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.9 ms