Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Sycp2Q9CUU3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
Sycp2Q9CUU3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
Sycp2Q9CUU3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
Sycp2Q9CUU3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
Sycp2Q9CUU3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC41.75■■■■■ 4.27
Sycp2Q9CUU3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC41.75■■■■■ 4.27
Sycp2Q9CUU3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
Sycp2Q9CUU3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
Sycp2Q9CUU3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC41.74■■■■■ 4.27
Sycp2Q9CUU3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
Sycp2Q9CUU3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC41.74■■■■■ 4.27
Sycp2Q9CUU3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC41.74■■■■■ 4.27
Sycp2Q9CUU3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
Sycp2Q9CUU3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
Sycp2Q9CUU3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
Sycp2Q9CUU3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
Sycp2Q9CUU3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
Sycp2Q9CUU3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC41.71■■■■■ 4.27
Sycp2Q9CUU3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
Sycp2Q9CUU3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
Sycp2Q9CUU3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
Sycp2Q9CUU3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
Sycp2Q9CUU3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC41.68■■■■■ 4.26
Sycp2Q9CUU3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC41.68■■■■■ 4.26
Sycp2Q9CUU3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
Sycp2Q9CUU3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
Sycp2Q9CUU3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
Sycp2Q9CUU3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
Sycp2Q9CUU3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
Sycp2Q9CUU3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Sycp2Q9CUU3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
Sycp2Q9CUU3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.65■■■■■ 4.26
Sycp2Q9CUU3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
Sycp2Q9CUU3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
Sycp2Q9CUU3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.26
Sycp2Q9CUU3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.63■■■■■ 4.25
Sycp2Q9CUU3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
Sycp2Q9CUU3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
Sycp2Q9CUU3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.63■■■■■ 4.25
Sycp2Q9CUU3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Sycp2Q9CUU3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Sycp2Q9CUU3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Sycp2Q9CUU3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Sycp2Q9CUU3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Sycp2Q9CUU3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.62■■■■■ 4.25
Sycp2Q9CUU3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Sycp2Q9CUU3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC41.61■■■■■ 4.25
Sycp2Q9CUU3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC41.61■■■■■ 4.25
Sycp2Q9CUU3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
Sycp2Q9CUU3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
Sycp2Q9CUU3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Sycp2Q9CUU3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC41.6■■■■■ 4.25
Sycp2Q9CUU3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
Sycp2Q9CUU3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Sycp2Q9CUU3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
Sycp2Q9CUU3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
Sycp2Q9CUU3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
Sycp2Q9CUU3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
Sycp2Q9CUU3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
Sycp2Q9CUU3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC41.57■■■■■ 4.25
Sycp2Q9CUU3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC41.55■■■■■ 4.24
Sycp2Q9CUU3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Sycp2Q9CUU3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
Sycp2Q9CUU3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC41.54■■■■■ 4.24
Sycp2Q9CUU3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC41.54■■■■■ 4.24
Sycp2Q9CUU3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
Sycp2Q9CUU3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
Sycp2Q9CUU3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
Sycp2Q9CUU3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
Sycp2Q9CUU3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
Sycp2Q9CUU3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
Sycp2Q9CUU3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
Sycp2Q9CUU3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC41.52■■■■■ 4.24
Sycp2Q9CUU3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
Sycp2Q9CUU3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC41.51■■■■■ 4.24
Sycp2Q9CUU3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
Sycp2Q9CUU3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
Sycp2Q9CUU3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
Sycp2Q9CUU3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC41.5■■■■■ 4.23
Sycp2Q9CUU3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Sycp2Q9CUU3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Sycp2Q9CUU3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
Sycp2Q9CUU3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC41.49■■■■■ 4.23
Sycp2Q9CUU3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC41.49■■■■■ 4.23
Sycp2Q9CUU3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC41.49■■■■■ 4.23
Sycp2Q9CUU3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Sycp2Q9CUU3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Sycp2Q9CUU3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
Sycp2Q9CUU3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Sycp2Q9CUU3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Sycp2Q9CUU3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Sycp2Q9CUU3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
Sycp2Q9CUU3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Sycp2Q9CUU3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
Sycp2Q9CUU3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Sycp2Q9CUU3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
Sycp2Q9CUU3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
Sycp2Q9CUU3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Sycp2Q9CUU3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms