Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lhfpl3Q9CTN8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lhfpl3Q9CTN8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lhfpl3Q9CTN8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lhfpl3Q9CTN8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lhfpl3Q9CTN8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lhfpl3Q9CTN8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lhfpl3Q9CTN8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lhfpl3Q9CTN8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lhfpl3Q9CTN8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lhfpl3Q9CTN8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lhfpl3Q9CTN8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lhfpl3Q9CTN8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lhfpl3Q9CTN8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lhfpl3Q9CTN8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lhfpl3Q9CTN8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lhfpl3Q9CTN8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lhfpl3Q9CTN8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lhfpl3Q9CTN8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lhfpl3Q9CTN8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lhfpl3Q9CTN8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lhfpl3Q9CTN8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lhfpl3Q9CTN8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lhfpl3Q9CTN8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lhfpl3Q9CTN8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lhfpl3Q9CTN8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lhfpl3Q9CTN8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lhfpl3Q9CTN8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lhfpl3Q9CTN8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lhfpl3Q9CTN8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lhfpl3Q9CTN8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lhfpl3Q9CTN8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lhfpl3Q9CTN8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lhfpl3Q9CTN8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lhfpl3Q9CTN8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lhfpl3Q9CTN8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lhfpl3Q9CTN8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lhfpl3Q9CTN8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lhfpl3Q9CTN8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lhfpl3Q9CTN8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lhfpl3Q9CTN8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lhfpl3Q9CTN8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lhfpl3Q9CTN8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms