Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN5

Six6os1, Protein SIX6OS1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6os1Q9CTN5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Six6os1Q9CTN5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Six6os1Q9CTN5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Six6os1Q9CTN5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Six6os1Q9CTN5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Six6os1Q9CTN5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Six6os1Q9CTN5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Six6os1Q9CTN5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Six6os1Q9CTN5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Six6os1Q9CTN5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Six6os1Q9CTN5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Six6os1Q9CTN5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Six6os1Q9CTN5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Six6os1Q9CTN5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Six6os1Q9CTN5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Six6os1Q9CTN5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Six6os1Q9CTN5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Six6os1Q9CTN5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Six6os1Q9CTN5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Six6os1Q9CTN5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Six6os1Q9CTN5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Six6os1Q9CTN5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Six6os1Q9CTN5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Six6os1Q9CTN5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Six6os1Q9CTN5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Six6os1Q9CTN5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Six6os1Q9CTN5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Six6os1Q9CTN5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Six6os1Q9CTN5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Six6os1Q9CTN5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Six6os1Q9CTN5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Six6os1Q9CTN5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Six6os1Q9CTN5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Six6os1Q9CTN5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Six6os1Q9CTN5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Six6os1Q9CTN5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Six6os1Q9CTN5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Six6os1Q9CTN5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Six6os1Q9CTN5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Six6os1Q9CTN5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Six6os1Q9CTN5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Six6os1Q9CTN5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Six6os1Q9CTN5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Six6os1Q9CTN5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Six6os1Q9CTN5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Six6os1Q9CTN5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Six6os1Q9CTN5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Six6os1Q9CTN5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Six6os1Q9CTN5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Six6os1Q9CTN5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Six6os1Q9CTN5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Six6os1Q9CTN5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Six6os1Q9CTN5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Six6os1Q9CTN5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Six6os1Q9CTN5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Six6os1Q9CTN5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Six6os1Q9CTN5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Six6os1Q9CTN5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Six6os1Q9CTN5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Six6os1Q9CTN5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Six6os1Q9CTN5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Six6os1Q9CTN5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Six6os1Q9CTN5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Six6os1Q9CTN5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Six6os1Q9CTN5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Six6os1Q9CTN5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Six6os1Q9CTN5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Six6os1Q9CTN5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Six6os1Q9CTN5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Six6os1Q9CTN5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Six6os1Q9CTN5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Six6os1Q9CTN5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Six6os1Q9CTN5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Six6os1Q9CTN5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Six6os1Q9CTN5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Six6os1Q9CTN5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Six6os1Q9CTN5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Six6os1Q9CTN5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Six6os1Q9CTN5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Six6os1Q9CTN5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Six6os1Q9CTN5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Six6os1Q9CTN5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Six6os1Q9CTN5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Six6os1Q9CTN5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Six6os1Q9CTN5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Six6os1Q9CTN5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Six6os1Q9CTN5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Six6os1Q9CTN5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Six6os1Q9CTN5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Six6os1Q9CTN5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Six6os1Q9CTN5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Six6os1Q9CTN5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Six6os1Q9CTN5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Six6os1Q9CTN5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Six6os1Q9CTN5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Six6os1Q9CTN5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Six6os1Q9CTN5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Six6os1Q9CTN5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Six6os1Q9CTN5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Six6os1Q9CTN5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms