Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ifitm3Q9CQW9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ifitm3Q9CQW9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ifitm3Q9CQW9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ifitm3Q9CQW9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ifitm3Q9CQW9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ifitm3Q9CQW9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ifitm3Q9CQW9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ifitm3Q9CQW9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ifitm3Q9CQW9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ifitm3Q9CQW9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ifitm3Q9CQW9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ifitm3Q9CQW9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ifitm3Q9CQW9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ifitm3Q9CQW9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ifitm3Q9CQW9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ifitm3Q9CQW9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ifitm3Q9CQW9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ifitm3Q9CQW9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ifitm3Q9CQW9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ifitm3Q9CQW9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ifitm3Q9CQW9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ifitm3Q9CQW9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ifitm3Q9CQW9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ifitm3Q9CQW9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ifitm3Q9CQW9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ifitm3Q9CQW9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ifitm3Q9CQW9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ifitm3Q9CQW9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ifitm3Q9CQW9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ifitm3Q9CQW9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ifitm3Q9CQW9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ifitm3Q9CQW9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ifitm3Q9CQW9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ifitm3Q9CQW9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ifitm3Q9CQW9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ifitm3Q9CQW9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ifitm3Q9CQW9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ifitm3Q9CQW9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ifitm3Q9CQW9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ifitm3Q9CQW9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ifitm3Q9CQW9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ifitm3Q9CQW9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ifitm3Q9CQW9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ifitm3Q9CQW9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ifitm3Q9CQW9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ifitm3Q9CQW9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ifitm3Q9CQW9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ifitm3Q9CQW9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ifitm3Q9CQW9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ifitm3Q9CQW9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ifitm3Q9CQW9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ifitm3Q9CQW9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ifitm3Q9CQW9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ifitm3Q9CQW9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ifitm3Q9CQW9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ifitm3Q9CQW9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ifitm3Q9CQW9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ifitm3Q9CQW9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ifitm3Q9CQW9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ifitm3Q9CQW9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ifitm3Q9CQW9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ifitm3Q9CQW9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ifitm3Q9CQW9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ifitm3Q9CQW9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ifitm3Q9CQW9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ifitm3Q9CQW9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ifitm3Q9CQW9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ifitm3Q9CQW9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ifitm3Q9CQW9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ifitm3Q9CQW9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ifitm3Q9CQW9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ifitm3Q9CQW9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ifitm3Q9CQW9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ifitm3Q9CQW9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ifitm3Q9CQW9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ifitm3Q9CQW9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ifitm3Q9CQW9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ifitm3Q9CQW9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ifitm3Q9CQW9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ifitm3Q9CQW9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ifitm3Q9CQW9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ifitm3Q9CQW9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ifitm3Q9CQW9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ifitm3Q9CQW9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ifitm3Q9CQW9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ifitm3Q9CQW9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ifitm3Q9CQW9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ifitm3Q9CQW9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ifitm3Q9CQW9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ifitm3Q9CQW9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ifitm3Q9CQW9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ifitm3Q9CQW9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ifitm3Q9CQW9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ifitm3Q9CQW9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ifitm3Q9CQW9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ifitm3Q9CQW9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ifitm3Q9CQW9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ifitm3Q9CQW9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms