Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE6

Asf1a, Histone chaperone ASF1A, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1aQ9CQE6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Asf1aQ9CQE6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Asf1aQ9CQE6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Asf1aQ9CQE6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Asf1aQ9CQE6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Asf1aQ9CQE6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Asf1aQ9CQE6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Asf1aQ9CQE6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Asf1aQ9CQE6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Asf1aQ9CQE6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Asf1aQ9CQE6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Asf1aQ9CQE6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Asf1aQ9CQE6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Asf1aQ9CQE6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Asf1aQ9CQE6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Asf1aQ9CQE6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Asf1aQ9CQE6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Asf1aQ9CQE6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Asf1aQ9CQE6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Asf1aQ9CQE6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Asf1aQ9CQE6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Asf1aQ9CQE6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Asf1aQ9CQE6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Asf1aQ9CQE6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Asf1aQ9CQE6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Asf1aQ9CQE6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Asf1aQ9CQE6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Asf1aQ9CQE6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Asf1aQ9CQE6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Asf1aQ9CQE6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Asf1aQ9CQE6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Asf1aQ9CQE6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Asf1aQ9CQE6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Asf1aQ9CQE6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Asf1aQ9CQE6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Asf1aQ9CQE6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Asf1aQ9CQE6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Asf1aQ9CQE6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Asf1aQ9CQE6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Asf1aQ9CQE6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Asf1aQ9CQE6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Asf1aQ9CQE6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Asf1aQ9CQE6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Asf1aQ9CQE6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Asf1aQ9CQE6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Asf1aQ9CQE6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Asf1aQ9CQE6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Asf1aQ9CQE6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Asf1aQ9CQE6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Asf1aQ9CQE6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Asf1aQ9CQE6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Asf1aQ9CQE6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Asf1aQ9CQE6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Asf1aQ9CQE6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Asf1aQ9CQE6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Asf1aQ9CQE6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Asf1aQ9CQE6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Asf1aQ9CQE6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Asf1aQ9CQE6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Asf1aQ9CQE6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Asf1aQ9CQE6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Asf1aQ9CQE6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Asf1aQ9CQE6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Asf1aQ9CQE6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Asf1aQ9CQE6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Asf1aQ9CQE6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Asf1aQ9CQE6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Asf1aQ9CQE6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Asf1aQ9CQE6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Asf1aQ9CQE6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Asf1aQ9CQE6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Asf1aQ9CQE6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Asf1aQ9CQE6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Asf1aQ9CQE6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Asf1aQ9CQE6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Asf1aQ9CQE6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Asf1aQ9CQE6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Asf1aQ9CQE6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Asf1aQ9CQE6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Asf1aQ9CQE6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Asf1aQ9CQE6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Asf1aQ9CQE6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Asf1aQ9CQE6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Asf1aQ9CQE6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Asf1aQ9CQE6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Asf1aQ9CQE6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Asf1aQ9CQE6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Asf1aQ9CQE6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Asf1aQ9CQE6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Asf1aQ9CQE6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Asf1aQ9CQE6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Asf1aQ9CQE6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Asf1aQ9CQE6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Asf1aQ9CQE6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Asf1aQ9CQE6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Asf1aQ9CQE6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Asf1aQ9CQE6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Asf1aQ9CQE6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Asf1aQ9CQE6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Asf1aQ9CQE6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.4 ms