Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab5aQ9CQD1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab5aQ9CQD1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab5aQ9CQD1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab5aQ9CQD1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab5aQ9CQD1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab5aQ9CQD1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab5aQ9CQD1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab5aQ9CQD1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab5aQ9CQD1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab5aQ9CQD1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab5aQ9CQD1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab5aQ9CQD1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab5aQ9CQD1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab5aQ9CQD1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab5aQ9CQD1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab5aQ9CQD1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab5aQ9CQD1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab5aQ9CQD1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab5aQ9CQD1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab5aQ9CQD1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab5aQ9CQD1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab5aQ9CQD1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab5aQ9CQD1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab5aQ9CQD1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab5aQ9CQD1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab5aQ9CQD1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab5aQ9CQD1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab5aQ9CQD1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab5aQ9CQD1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab5aQ9CQD1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab5aQ9CQD1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab5aQ9CQD1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab5aQ9CQD1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab5aQ9CQD1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab5aQ9CQD1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab5aQ9CQD1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms