Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA0

Cenpm, Centromere protein M, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpmQ9CQA0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CenpmQ9CQA0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CenpmQ9CQA0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CenpmQ9CQA0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CenpmQ9CQA0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CenpmQ9CQA0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CenpmQ9CQA0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CenpmQ9CQA0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CenpmQ9CQA0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CenpmQ9CQA0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CenpmQ9CQA0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CenpmQ9CQA0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CenpmQ9CQA0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CenpmQ9CQA0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CenpmQ9CQA0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CenpmQ9CQA0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CenpmQ9CQA0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CenpmQ9CQA0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CenpmQ9CQA0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CenpmQ9CQA0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CenpmQ9CQA0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CenpmQ9CQA0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CenpmQ9CQA0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CenpmQ9CQA0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CenpmQ9CQA0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CenpmQ9CQA0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CenpmQ9CQA0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CenpmQ9CQA0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CenpmQ9CQA0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CenpmQ9CQA0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CenpmQ9CQA0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CenpmQ9CQA0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CenpmQ9CQA0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CenpmQ9CQA0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CenpmQ9CQA0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CenpmQ9CQA0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CenpmQ9CQA0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CenpmQ9CQA0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CenpmQ9CQA0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CenpmQ9CQA0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CenpmQ9CQA0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CenpmQ9CQA0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CenpmQ9CQA0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CenpmQ9CQA0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CenpmQ9CQA0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CenpmQ9CQA0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CenpmQ9CQA0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CenpmQ9CQA0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms