Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
StambpQ9CQ26 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
StambpQ9CQ26 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
StambpQ9CQ26 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
StambpQ9CQ26 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
StambpQ9CQ26 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
StambpQ9CQ26 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
StambpQ9CQ26 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
StambpQ9CQ26 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
StambpQ9CQ26 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
StambpQ9CQ26 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
StambpQ9CQ26 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
StambpQ9CQ26 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
StambpQ9CQ26 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
StambpQ9CQ26 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
StambpQ9CQ26 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
StambpQ9CQ26 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
StambpQ9CQ26 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
StambpQ9CQ26 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
StambpQ9CQ26 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
StambpQ9CQ26 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
StambpQ9CQ26 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
StambpQ9CQ26 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
StambpQ9CQ26 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
StambpQ9CQ26 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
StambpQ9CQ26 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
StambpQ9CQ26 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
StambpQ9CQ26 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
StambpQ9CQ26 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
StambpQ9CQ26 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
StambpQ9CQ26 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
StambpQ9CQ26 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
StambpQ9CQ26 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
StambpQ9CQ26 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
StambpQ9CQ26 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
StambpQ9CQ26 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
StambpQ9CQ26 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
StambpQ9CQ26 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
StambpQ9CQ26 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
StambpQ9CQ26 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
StambpQ9CQ26 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
StambpQ9CQ26 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
StambpQ9CQ26 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
StambpQ9CQ26 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
StambpQ9CQ26 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
StambpQ9CQ26 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
StambpQ9CQ26 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
StambpQ9CQ26 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
StambpQ9CQ26 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
StambpQ9CQ26 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
StambpQ9CQ26 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
StambpQ9CQ26 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
StambpQ9CQ26 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
StambpQ9CQ26 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
StambpQ9CQ26 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
StambpQ9CQ26 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
StambpQ9CQ26 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
StambpQ9CQ26 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
StambpQ9CQ26 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
StambpQ9CQ26 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms