Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trim26Q99PN3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trim26Q99PN3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trim26Q99PN3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trim26Q99PN3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trim26Q99PN3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trim26Q99PN3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trim26Q99PN3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trim26Q99PN3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trim26Q99PN3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trim26Q99PN3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trim26Q99PN3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trim26Q99PN3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trim26Q99PN3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trim26Q99PN3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trim26Q99PN3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trim26Q99PN3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trim26Q99PN3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trim26Q99PN3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trim26Q99PN3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trim26Q99PN3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trim26Q99PN3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trim26Q99PN3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trim26Q99PN3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trim26Q99PN3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trim26Q99PN3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trim26Q99PN3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trim26Q99PN3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trim26Q99PN3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trim26Q99PN3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trim26Q99PN3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trim26Q99PN3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trim26Q99PN3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trim26Q99PN3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trim26Q99PN3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Trim26Q99PN3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trim26Q99PN3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trim26Q99PN3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trim26Q99PN3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Trim26Q99PN3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trim26Q99PN3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trim26Q99PN3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trim26Q99PN3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trim26Q99PN3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trim26Q99PN3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Trim26Q99PN3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trim26Q99PN3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trim26Q99PN3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trim26Q99PN3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trim26Q99PN3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trim26Q99PN3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trim26Q99PN3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trim26Q99PN3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trim26Q99PN3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trim26Q99PN3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trim26Q99PN3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trim26Q99PN3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trim26Q99PN3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trim26Q99PN3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trim26Q99PN3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trim26Q99PN3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trim26Q99PN3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trim26Q99PN3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trim26Q99PN3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trim26Q99PN3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trim26Q99PN3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trim26Q99PN3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trim26Q99PN3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trim26Q99PN3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trim26Q99PN3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trim26Q99PN3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trim26Q99PN3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trim26Q99PN3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trim26Q99PN3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trim26Q99PN3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trim26Q99PN3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trim26Q99PN3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trim26Q99PN3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trim26Q99PN3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trim26Q99PN3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trim26Q99PN3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trim26Q99PN3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trim26Q99PN3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trim26Q99PN3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trim26Q99PN3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trim26Q99PN3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trim26Q99PN3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trim26Q99PN3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trim26Q99PN3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trim26Q99PN3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trim26Q99PN3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trim26Q99PN3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trim26Q99PN3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trim26Q99PN3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trim26Q99PN3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trim26Q99PN3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trim26Q99PN3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trim26Q99PN3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trim26Q99PN3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trim26Q99PN3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms