Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP3

Calcb, Calcitonin gene-related peptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CalcbQ99MP3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CalcbQ99MP3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CalcbQ99MP3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CalcbQ99MP3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CalcbQ99MP3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CalcbQ99MP3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CalcbQ99MP3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CalcbQ99MP3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CalcbQ99MP3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CalcbQ99MP3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CalcbQ99MP3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CalcbQ99MP3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CalcbQ99MP3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CalcbQ99MP3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CalcbQ99MP3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CalcbQ99MP3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CalcbQ99MP3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CalcbQ99MP3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CalcbQ99MP3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CalcbQ99MP3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CalcbQ99MP3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CalcbQ99MP3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CalcbQ99MP3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CalcbQ99MP3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CalcbQ99MP3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CalcbQ99MP3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CalcbQ99MP3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CalcbQ99MP3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CalcbQ99MP3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CalcbQ99MP3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CalcbQ99MP3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CalcbQ99MP3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CalcbQ99MP3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CalcbQ99MP3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CalcbQ99MP3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CalcbQ99MP3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CalcbQ99MP3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CalcbQ99MP3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CalcbQ99MP3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CalcbQ99MP3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CalcbQ99MP3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CalcbQ99MP3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CalcbQ99MP3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CalcbQ99MP3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CalcbQ99MP3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CalcbQ99MP3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CalcbQ99MP3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CalcbQ99MP3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CalcbQ99MP3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CalcbQ99MP3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CalcbQ99MP3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CalcbQ99MP3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CalcbQ99MP3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CalcbQ99MP3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CalcbQ99MP3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CalcbQ99MP3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CalcbQ99MP3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CalcbQ99MP3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CalcbQ99MP3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CalcbQ99MP3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CalcbQ99MP3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CalcbQ99MP3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CalcbQ99MP3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CalcbQ99MP3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CalcbQ99MP3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CalcbQ99MP3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CalcbQ99MP3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CalcbQ99MP3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CalcbQ99MP3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CalcbQ99MP3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CalcbQ99MP3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CalcbQ99MP3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CalcbQ99MP3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CalcbQ99MP3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CalcbQ99MP3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CalcbQ99MP3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CalcbQ99MP3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CalcbQ99MP3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CalcbQ99MP3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CalcbQ99MP3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CalcbQ99MP3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CalcbQ99MP3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CalcbQ99MP3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CalcbQ99MP3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CalcbQ99MP3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CalcbQ99MP3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CalcbQ99MP3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CalcbQ99MP3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CalcbQ99MP3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CalcbQ99MP3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CalcbQ99MP3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CalcbQ99MP3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CalcbQ99MP3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CalcbQ99MP3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CalcbQ99MP3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CalcbQ99MP3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CalcbQ99MP3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CalcbQ99MP3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CalcbQ99MP3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CalcbQ99MP3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.1 ms