Protein–RNA interactions for Protein: Q99MJ6

Pdzd3, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF4, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd3Q99MJ6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzd3Q99MJ6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzd3Q99MJ6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzd3Q99MJ6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdzd3Q99MJ6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdzd3Q99MJ6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdzd3Q99MJ6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdzd3Q99MJ6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdzd3Q99MJ6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdzd3Q99MJ6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdzd3Q99MJ6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdzd3Q99MJ6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdzd3Q99MJ6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdzd3Q99MJ6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdzd3Q99MJ6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdzd3Q99MJ6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdzd3Q99MJ6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdzd3Q99MJ6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdzd3Q99MJ6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdzd3Q99MJ6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdzd3Q99MJ6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdzd3Q99MJ6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdzd3Q99MJ6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdzd3Q99MJ6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdzd3Q99MJ6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdzd3Q99MJ6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdzd3Q99MJ6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdzd3Q99MJ6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdzd3Q99MJ6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdzd3Q99MJ6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdzd3Q99MJ6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdzd3Q99MJ6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdzd3Q99MJ6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdzd3Q99MJ6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdzd3Q99MJ6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdzd3Q99MJ6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdzd3Q99MJ6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdzd3Q99MJ6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdzd3Q99MJ6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdzd3Q99MJ6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdzd3Q99MJ6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdzd3Q99MJ6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdzd3Q99MJ6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdzd3Q99MJ6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdzd3Q99MJ6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdzd3Q99MJ6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdzd3Q99MJ6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdzd3Q99MJ6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdzd3Q99MJ6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdzd3Q99MJ6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdzd3Q99MJ6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdzd3Q99MJ6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdzd3Q99MJ6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdzd3Q99MJ6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdzd3Q99MJ6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdzd3Q99MJ6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdzd3Q99MJ6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdzd3Q99MJ6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdzd3Q99MJ6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdzd3Q99MJ6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdzd3Q99MJ6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdzd3Q99MJ6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdzd3Q99MJ6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdzd3Q99MJ6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdzd3Q99MJ6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdzd3Q99MJ6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdzd3Q99MJ6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdzd3Q99MJ6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdzd3Q99MJ6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdzd3Q99MJ6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdzd3Q99MJ6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdzd3Q99MJ6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdzd3Q99MJ6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdzd3Q99MJ6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdzd3Q99MJ6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdzd3Q99MJ6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdzd3Q99MJ6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdzd3Q99MJ6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdzd3Q99MJ6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdzd3Q99MJ6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdzd3Q99MJ6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdzd3Q99MJ6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdzd3Q99MJ6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzd3Q99MJ6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzd3Q99MJ6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzd3Q99MJ6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzd3Q99MJ6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzd3Q99MJ6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzd3Q99MJ6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pdzd3Q99MJ6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pdzd3Q99MJ6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdzd3Q99MJ6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdzd3Q99MJ6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdzd3Q99MJ6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdzd3Q99MJ6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdzd3Q99MJ6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdzd3Q99MJ6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdzd3Q99MJ6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdzd3Q99MJ6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdzd3Q99MJ6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms