Protein–RNA interactions for Protein: Q99M08

Uncharacterized protein C4orf3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99M08 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q99M08 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q99M08 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q99M08 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q99M08 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q99M08 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q99M08 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q99M08 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q99M08 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q99M08 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q99M08 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q99M08 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q99M08 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q99M08 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q99M08 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q99M08 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q99M08 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q99M08 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q99M08 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q99M08 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q99M08 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q99M08 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q99M08 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q99M08 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q99M08 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q99M08 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q99M08 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q99M08 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q99M08 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q99M08 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q99M08 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q99M08 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q99M08 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q99M08 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q99M08 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q99M08 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q99M08 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q99M08 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q99M08 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q99M08 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q99M08 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q99M08 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q99M08 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q99M08 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q99M08 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q99M08 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q99M08 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q99M08 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q99M08 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q99M08 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q99M08 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q99M08 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q99M08 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q99M08 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q99M08 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q99M08 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q99M08 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q99M08 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q99M08 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q99M08 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q99M08 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q99M08 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q99M08 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q99M08 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q99M08 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q99M08 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q99M08 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q99M08 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q99M08 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q99M08 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q99M08 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q99M08 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q99M08 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q99M08 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q99M08 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q99M08 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q99M08 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q99M08 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q99M08 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q99M08 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q99M08 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q99M08 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q99M08 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q99M08 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q99M08 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q99M08 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q99M08 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q99M08 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q99M08 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q99M08 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q99M08 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q99M08 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q99M08 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q99M08 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q99M08 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q99M08 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q99M08 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q99M08 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q99M08 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q99M08 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms