Protein–RNA interactions for Protein: Q99LC9

Pex6, Peroxisome assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex6Q99LC9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pex6Q99LC9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pex6Q99LC9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pex6Q99LC9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pex6Q99LC9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pex6Q99LC9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pex6Q99LC9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pex6Q99LC9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pex6Q99LC9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pex6Q99LC9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pex6Q99LC9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pex6Q99LC9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pex6Q99LC9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pex6Q99LC9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pex6Q99LC9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pex6Q99LC9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pex6Q99LC9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pex6Q99LC9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pex6Q99LC9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pex6Q99LC9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pex6Q99LC9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pex6Q99LC9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pex6Q99LC9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pex6Q99LC9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pex6Q99LC9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pex6Q99LC9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pex6Q99LC9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pex6Q99LC9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pex6Q99LC9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pex6Q99LC9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pex6Q99LC9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pex6Q99LC9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pex6Q99LC9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pex6Q99LC9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pex6Q99LC9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pex6Q99LC9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pex6Q99LC9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pex6Q99LC9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pex6Q99LC9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pex6Q99LC9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pex6Q99LC9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pex6Q99LC9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pex6Q99LC9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pex6Q99LC9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pex6Q99LC9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pex6Q99LC9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pex6Q99LC9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pex6Q99LC9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pex6Q99LC9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pex6Q99LC9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pex6Q99LC9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pex6Q99LC9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pex6Q99LC9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pex6Q99LC9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pex6Q99LC9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pex6Q99LC9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pex6Q99LC9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pex6Q99LC9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pex6Q99LC9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pex6Q99LC9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pex6Q99LC9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pex6Q99LC9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pex6Q99LC9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pex6Q99LC9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pex6Q99LC9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pex6Q99LC9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pex6Q99LC9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pex6Q99LC9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pex6Q99LC9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pex6Q99LC9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pex6Q99LC9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pex6Q99LC9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pex6Q99LC9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pex6Q99LC9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pex6Q99LC9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pex6Q99LC9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pex6Q99LC9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pex6Q99LC9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pex6Q99LC9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pex6Q99LC9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pex6Q99LC9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pex6Q99LC9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pex6Q99LC9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pex6Q99LC9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pex6Q99LC9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pex6Q99LC9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pex6Q99LC9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pex6Q99LC9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pex6Q99LC9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pex6Q99LC9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pex6Q99LC9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pex6Q99LC9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pex6Q99LC9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pex6Q99LC9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pex6Q99LC9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pex6Q99LC9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms