Protein–RNA interactions for Protein: Q99KS2

Ngrn, Neugrin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgrnQ99KS2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NgrnQ99KS2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NgrnQ99KS2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NgrnQ99KS2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NgrnQ99KS2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NgrnQ99KS2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NgrnQ99KS2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NgrnQ99KS2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NgrnQ99KS2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NgrnQ99KS2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NgrnQ99KS2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NgrnQ99KS2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NgrnQ99KS2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NgrnQ99KS2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NgrnQ99KS2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NgrnQ99KS2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NgrnQ99KS2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NgrnQ99KS2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NgrnQ99KS2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NgrnQ99KS2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NgrnQ99KS2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NgrnQ99KS2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NgrnQ99KS2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NgrnQ99KS2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NgrnQ99KS2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NgrnQ99KS2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NgrnQ99KS2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NgrnQ99KS2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NgrnQ99KS2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NgrnQ99KS2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NgrnQ99KS2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NgrnQ99KS2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NgrnQ99KS2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NgrnQ99KS2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NgrnQ99KS2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NgrnQ99KS2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NgrnQ99KS2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NgrnQ99KS2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NgrnQ99KS2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NgrnQ99KS2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NgrnQ99KS2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms